Recombined Template REC-0-5_002

Consensus Sequence

DIVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHENWSNYLAWYLQVKPSQSPQLLIYLGSSRASGVPDRFSGSGSDKDQKLKISRVETEDVGTYYCMQGRESPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREALVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTLTLNNDLTLLKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSGLRMEC

Annotated Consensus Sequence

ConsensusTemplate

LML

HLH

SPS

KRK

CDR1HQH

ESE

WGW

SYS

ADA

V.V

SGS

CDR2GG

SNS

DGD

KTK

QFQ

KTK

TAT

TVT

CDR3QQ

GAG

RLR

EQE

STS

DED

SLTVSL

LKL

LYL

TST

NSN

DTD

LSL

YDY

GFG

LNL

MGM

Legend

CDRConservedPossible glycosylation site

Sequence Consensus Overview

GDT

LDTS

GLP

TLH

SNV

PTS

HLC

DNLK

THES

ENYTS

YQKPLH

SLKNH

KTSGE

AGSDN

NSARGW

GHNTYS

RYCDN

AHGY

GLYTWEDA

VRKQWYW

LVYA

QVL

EVPAGQVQ

AEFKVKPVA

DSPGKA

YPA

YGRQS

LGVQ

APVDY

SVLAG

AGVETS

GTES

VLTDR

PGDNSVA

QATVS

PVG

LTGAV

GLAP

AVEGD

ALEFR

ADF

ELDQS

LSG

LTSED

LTK

ELD

GLFQ

QSLTK

MSTVLK

AVGS

LKGLR

RLVLD

AGFSTEA

PLT

LYE

KLV

HMASC

KDCPEM

SVLR

SRQE

TMS

GSA

DTA

KVR

TGSTV

FTGLA

DLA

ASP

AVEFS

KDPVL

WREPF

RNP

STP

LKES

NTVSFPD

KLSE

LMSPQ

LKL

FLKA

AEQGAS

STA

GFAV

SLC

HGPL

SDN

EGAGGDN

PTSF

ANDHY

DAGLRE

HVAKL

DGFLNQ

MATDANEQW

QAK

SYLV

KED

DMLANGQ

ALVCQ

PNAS

LADVN

SGQ

DSWPQVE

VTGS

SLV

SDMPT

DHE

DEQ

VTS

VANK

GYD

LDENS

NLDST

TSN

DLSN

NTD

NSLKA

KHETLRQY

WALCDY

YNVDEGVT

DKHKA

GDLHA

CAK

QVYV

PKVYA

DLGC

PGAV

TASLA

LETS

TQES

QAVLS

DLTA

VLGK

RFG

WFL

NAR

SNFM

0		1	0	E	1	0.86483	D	1	32.44349387619048
1		1	0	W	1	1.2984499999999999	F	1	19.040152300000003	L	1	19.83707519047619
2	D	1	0.98249	S	1	0.9985	C	1	0.99999	Q	1	1.32144	T	1	2.99801	V	1	39.385693966666665
3	Q	1	0	V	1	0.87174	E	1	0.99	S	1	1.9331966666666667	L	1	51.236052461904755	TQL	3	0.6683333333333333
4	C	1	0.4967975	L	1	0.5828466666666666	A	1	0.60821	Q	1	0.7129385714285715	N	1	0.9792	Y	1	0.99923	V	1	0.99953	H	1	0.99999	E	1	1.33659	W	1	1.926958	S	1	2.46956	G	1	2.99055	D	1	5.443466666666668	T	1	27.955685804761902	QT	2	2.5352750000000004
5	N	1	0.19095	V	1	0.30258	D	1	0.3150733333333333	R	1	0.33186	GA	1	0.47357625	Y	1	0.69098	T	1	0.99858	AG	1	0.99994	A	1	1.57917	L	1	1.8975999999999997	E	1	2.2049600000000003	G	1	2.9319793333333335	Q	1	26.091919699999995	TN	2	0.90955	SAG	2	1	NT	2	1.319115	SQ	2	2.088
6	F	1	0	Q	1	0.24085	E	1	0.38088	Y	1	0.94184	N	1	0.99984	P	1	0.99989	R	1	1.2893766666666666	L	1	2.74575	D	1	3.1649699999999994	T	1	3.2498899999999997	S	1	36.709385542857135
7		1	0	D	1	0.2168	Y	1	0.4042	E	1	0.9431	A	1	0.99019	M	1	0.99839	K	1	0.99905	C	1	0.9999	N	1	1	T	1	1.532604	S	1	2.76527	G	1	3.564	L	1	4.13992623015873	P	1	43.43773908571427
8		1	0	Q	1	0.12272	D	1	0.42281	C	1	0.5992040000000001	A	1	0.88355	S	1	0.99438	V	1	0.99709	E	1	1	F	1	1.05742	G	1	1.68601	P	1	2.4917768253968253	T	1	3.527622666666667	L	1	11.813623214285714	H	1	26.19962283333333	SH	2	0.99346
9		1	0	G	1	0	Q	1	0.20104	K	1	0.33843	R	1	0.61864	D	1	0.95508	H	1	0.96482	M	1	0.99574	E	1	1.92908	C	1	1.9322273333333335	T	1	2.84854	L	1	5.338972698412698	S	1	47.02473277450981	VT	2	0.62361	TV	2	3.146
10		1	0	C	1	0.18757666666666664	V	1	0.29787	N	1	0.36702	T	1	0.5995820000000001	Q	1	0.90684	K	1	0.98856	R	1	0.99363	Y	1	1.9983	S	1	2.9329946666666666	L	1	53.829596138188606
11		1	0	E	1	0.3276266666666667	L	1	0.58117	R	1	0.96666	A	1	0.9952	V	1	0.9999	D	1	1	P	1	1.0686200000000001	G	1	1.48114	W	1	1.8823400000000001	N	1	2.09128	T	1	5.926541333333334	S	1	49.840014530345464
12		1	0	W	1	0	Y	1	0.33215333333333336	L	1	0.99883	A	1	1	E	1	1.09893	Q	1	1.3501400000000001	H	1	2.23932	S	1	4.134208666666667	N	1	4.134345714285715	V	1	39.75184408963586	LS	2	0.89352	SL	2	2.049825
13	G	1	0		1	0	K	1	0.33276666666666666	S	1	0.79266	N	1	0.97233	R	1	0.97707	V	1	0.99983	A	1	0.99991	L	1	2.45029	T	1	54.71743027824462
14	N	1	0		1	0	M	1	0.31854	W	1	0.3318	G	1	0.6860171428571429	L	1	0.99936	D	1	1.52905	C	1	1.6326011111111112	S	1	1.68456	K	1	1.96183	P	1	57.423205019607835	GP	2	0.84994
15	H	1	0		1	0	E	1	0.29606	R	1	0.69981	Y	1	0.94534	L	1	1	M	1	1	D	1	1.36677	P	1	2.76945	A	1	5.27341	G	1	47.917115314659206
16		1	0	Q	1	0.25929	N	1	0.27599	Y	1	0.58382	H	1	0.63388	R	1	0.69934	G	1	1.5061499999999999	K	1	1.53802	S	1	1.55478	D	1	1.7702200000000001	P	1	1.935	L	1	2.59476	V	1	6.415811333333333	E	1	32.646640147058825	SE	2	0
17	D	1	0		1	0	H	1	0.24981	E	1	0.3330033333333333	R	1	0.96765	M	1	1	L	1	1.3528025	T	1	1.6592799999999999	Q	1	2.814423333333333	Y	1	2.994214	A	1	2.99838	S	1	48.56536370308124	AS	2	1	GT	2	3.246
18	C	1	0		1	0	R	1	0.2594033333333333	E	1	0.55752	H	1	0.566	V	1	0.99828	M	1	1	F	1	1.2708366666666668	N	1	1.90769	P	1	1.99993	Q	1	2.49386	L	1	2.99382	A	1	50.94373588515405
19	Y	1	0		1	0	F	1	0.09514666666666667	G	1	0.99356	K	1	0.99712	P	1	0.99991	A	1	1	V	1	1.3332833333333334	R	1	2.2915099999999997	T	1	2.58819	D	1	2.7450099999999997	L	1	2.7851	S	1	62.63030557422969	TV	2	2.6704749999999997
20	N	1	0		1	0	Y	1	0.30987750000000003	P	1	0.64611	Q	1	0.75153	R	1	0.86811	E	1	1.21738	D	1	1.4414	G	1	1.497965	S	1	1.52755	L	1	64.96219560224088
21		1	0	D	1	0.05452749999999999	G	1	0.13888	V	1	0.32949	M	1	0.88791	R	1	1.30985	H	1	1.43868	E	1	1.65031	L	1	2.26957	N	1	2.7584999999999997	P	1	7.308483333333333	T	1	9.89772	S	1	43.18438672268907	CS	2	3.5431099999999995
22		1	0	F	1	0.08408	D	1	0.3349	T	1	0.33658	Q	1	0.92212	R	1	0.94391	E	1	0.94464	W	1	1	Y	1	1.44266	M	1	1.46501	N	1	1.51095	A	1	1.99975	P	1	2.5220933333333333	S	1	2.83594	G	1	3.0740675000000004	H	1	7.060409999999999	L	1	12.440400833333333	C	1	24.86478966386555
23		1	0	M	1	0.07908	Q	1	0.2584	G	1	0.33236666666666664	R	1	0.43305	F	1	0.9815999999999999	V	1	0.99985	C	1	1.20822	A	1	1.31215	T	1	1.4970999999999999	E	1	1.82964	Y	1	1.96456	H	1	2.25455	S	1	2.289075	P	1	2.6677750000000002	D	1	4.41034	N	1	4.74292	L	1	7.317453333333333	K	1	25.358397563025214
24	F	1	0		1	0	D	1	0.49280499999999994	M	1	0.72878	G	1	0.94449	V	1	0.99924	A	1	0.99932	P	1	0.99936	L	1	1	Y	1	1.51182	C	1	1.53522	N	1	1.57993	T	1	3.19207	H	1	3.2204699999999997	E	1	3.54232	S	1	23.10988857142857
25	R	1	0		1	0	H	1	0.12363285714285714	W	1	0.33333	Q	1	0.37843000000000004	M	1	0.37870000000000004	C	1	0.45909500000000003	K	1	0.50756	G	1	1.48861	D	1	1.84032	P	1	1.99845	E	1	2.15405	N	1	2.7647899999999996	Y	1	3.96082	T	1	4.68008	S	1	20.307932500000003
26	W	1	0		1	0	S	1	0	M	1	0	E	1	0.10315250000000001	C	1	0.2171	F	1	0.488815	A	1	0.52082	N	1	1.1110200000000001	G	1	1.5972285714285714	Y	1	2.32721	Q	1	2.51026	K	1	3.60683	P	1	4.23398	L	1	4.91655	H	1	19.5784975
27		1	0	M	1	0.18637	V	1	0.47802500000000003	L	1	0.49965	G	1	0.81552	D	1	0.93144	P	1	0.93435	E	1	2.5339066666666668	T	1	10.86236	S	1	34.66980206959707
28		1	0	M	1	0.07101666666666666	E	1	0.2045	Q	1	0.24059	T	1	0.51778	S	1	0.54213	G	1	1.27075	N	1	1.3152566666666667	D	1	1.9344400000000002	L	1	49.16800933150183
29	G	1	0.47321	W	1	0.5292	P	1	0.95138	D	1	0.96668	K	1	0.99731	Y	1	1.3333233333333334	V	1	1.99013	L	1	52.80870215201465
30		1	0	T	1	0	A	1	0.08962	E	1	0.78255	Q	1	0.98175	V	1	0.98214	Y	1	0.99634	F	1	0.99971	W	1	1.1374766666666667	D	1	2.04255	S	1	2.6641	L	1	3.6549199999999997	K	1	5.33283	N	1	12.455539917582417	H	1	15.73348
31		1	0	D	1	0	N	1	0.17832	M	1	0.49976	Q	1	0.97878	Y	1	0.99865	A	1	0.99991	P	1	1.78858	K	1	2.72662	T	1	3.3620099999999997	S	1	10.503803333333336	G	1	10.99685	E	1	11.943810567765567
32		1	0	Q	1	0.43775	P	1	0.71225	K	1	0.96916	V	1	0.98253	H	1	0.99914	A	1	1.95983	G	1	1.9954	S	1	3.0981500000000004	D	1	9.43451	N	1	17.42738525641025
33		1	0	M	1	0.4991625	F	1	0.99191	P	1	0.99895	T	1	0.99961	D	1	1.32605	Q	1	1.4326400000000001	H	1	1.77834	N	1	2.8527	S	1	3.0055899999999998	A	1	3.08652	R	1	4.22223	G	1	6.0471125	W	1	12.07618815018315
34		1	0	A	1	0.09159499999999998	M	1	0.27761	K	1	0.31806749999999995	D	1	0.73418	R	1	0.86646	P	1	0.90945	E	1	0.98766	L	1	0.99812	V	1	0.99977	G	1	1.25684	H	1	1.6542400000000002	N	1	2.3263800000000003	T	1	3.01822	Y	1	4.16047	S	1	4.248996666666667
35	M	1	0.04559	Q	1	0.06478	S	1	0.4415	GG	1	0.682485	G	1	0.8715799999999999	L	1	0.93513	T	1	0.99819	P	1	1	R	1	1.25215	Y	1	1.63211	C	1	1.9999099999999999	D	1	3.7102933333333334	N	1	9.211412666666668
36	M	1	0.63594	V	1	0.79153	T	1	0.96028	K	1	0.99586	E	1	0.99945	A	1	1.3256433333333333	H	1	1.77809	G	1	2.9780100000000003	Y	1	15.705204333333338
37	K	1	0.86793	N	1	1.32906	L	1	15.440968333333332
38	G	1	0.86867	L	1	0.95791	Y	1	0.97123	T	1	0.99346	W	1	0.99783	E	1	1.34254	D	1	3.3343233333333333	A	1	6.811132
39		1	0	L	1	0.13836	S	1	0.47076	V	1	0.98532	R	1	0.99394	K	1	1.2997866666666666	Q	1	1.63232	W	1	6.450632	YW	2	0.992795
40	L	1	1.56029	V	1	1.6578	Y	1	7.793359
41	E	1	0.13649	Q	1	0.86835	V	1	6.782306	L	1	9.198870000000001
42	E	1	0.97929	V	1	0.99202	P	1	0.99972	AG	1	1.87734	Q	1	12.359703000000001	VQ	2	1.9479950000000001
43	S	1	0.78369	A	1	0.90967	E	1	0.99226	F	1	1.37025	K	1	3.797625	V	1	7.01082	KPV	3	0.9609666666666666
44	V	1	0		1	0	Y	1	0.15967	R	1	0.44405	D	1	0.86289	S	1	1.99705	P	1	2.99848	G	1	3.796869	K	1	3.95119
45		1	0	F	1	0.37221	Y	1	3.9924399999999998	P	1	16.053708499999995
46		1	0	H	1	0.83556	L	1	0.95755	A	1	1	Y	1	1.99025	G	1	3.1578	R	1	3.219437	Q	1	4.55963	S	1	8.511849166666666	QS	2	0.955725
47	GA	1	0	AA	1	0.506385	E	1	0.68313	T	1	0.80793	R	1	0.98806	D	1	1	L	1	1.9446400000000001	G	1	4.553121666666667	V	1	4.57864	Q	1	9.54485
48	Q	1	0.26093	K	1	0.76809	N	1	0.79857	L	1	0.85533	E	1	1.73826	V	1	1.76604	R	1	1.8892099999999998	T	1	3.99915	S	1	33.476748190476194
49		1	0	C	1	0.13314	T	1	0.93881	H	1	0.94806	G	1	0.99983	F	1	1.2068666666666668	V	1	1.23135	S	1	1.89298	L	1	2.11952	P	1	41.60447085714284	QP	2	0.73186
50		1	0	G	1	0	W	1	0.07551	E	1	0.17161	D	1	0.91018	AA	1	0.9955350000000001	T	1	0.99987	S	1	0.99988	AG	1	1.56513	L	1	1.61389	P	1	1.87908	Y	1	1.98704	N	1	2.11802	V	1	2.60543	A	1	4.271235	Q	1	38.97125788492063
51		1	0	N	1	0	E	1	0.622	K	1	0.86103	R	1	0.89193	P	1	0.99997	W	1	1.387515	G	1	1.4789	S	1	1.6783366666666666	V	1	1.85149	Q	1	1.98362	T	1	2.7844	D	1	2.9246	A	1	3.99994	L	1	56.64381689285715
52		1	0	Y	1	0	R	1	0	W	1	0.17082	A	1	0.43063	N	1	0.99743	T	1	1.6589716666666667	Q	1	1.75857	K	1	2.60465	V	1	2.89741	S	1	5.71499	L	1	64.99276145634923
53		1	0	C	1	0	T	1	0.03703666666666667	Y	1	0.754641	R	1	0.8221008333333333	E	1	0.99125	H	1	0.99304	D	1	0.99956	F	1	0.99983	A	1	0.99991	V	1	1.80467	S	1	3.90937	P	1	3.9995	G	1	5.227865	L	1	64.97354358730159
54	T	1	0		1	0	H	1	0	R	1	0.44792	W	1	0.96752	C	1	0.99967	N	1	1.5996299999999999	E	1	1.9150999999999998	L	1	1.95069	S	1	2.32875	G	1	2.499693333333333	K	1	2.8459	A	1	4.7163200000000005	P	1	6.664283333333334	V	1	8.4480725	D	1	25.557891611111113	Y	1	28.157900000000005
55		1	0	T	1	0	N	1	0.85562	W	1	0.9871	K	1	0.99343	E	1	0.99642	A	1	0.99818	D	1	2.37204	M	1	2.75371	G	1	2.89407	Q	1	2.98074	S	1	2.99295	L	1	70.02519058333331	VA	2	0.669455	GL	2	1.4975825	GVT	3	0.8655266666666667
56		1	0	E	1	0.54918	H	1	0.6	D	1	0.6221066666666667	R	1	0.96378	K	1	0.99478	F	1	0.99902	N	1	1.9558200000000001	P	1	1.99953	Q	1	2.1767000000000003	S	1	5.16448	V	1	5.29612	L	1	10.473876666666666	A	1	24.304554452380952	G	1	29.203960000000006	SG	2	2.288295
57	D	1	0.69273	M	1	0.91275	C	1	0.99958	L	1	1.17271	R	1	1.98112	P	1	3.572	A	1	4.1903966666666665	G	1	5.54873	V	1	6.098815833333333	E	1	6.26908	T	1	11.100550000000002	S	1	40.379520154761906
58		1	0	F	1	0	W	1	0.27974333333333334	Q	1	0.8614299999999999	M	1	0.94686	Y	1	0.95594	P	1	0.99996	A	1	1.6825633333333334	L	1	1.8745	V	1	1.9977399999999998	N	1	3.5774833333333333	D	1	3.78343	G	1	4.6246	T	1	5.031839999999999	E	1	17.147626694444444	S	1	38.38126690476191	RS	2	0.406465
59		1	0	N	1	0.7172	AV	1	0.9847250000000001	Q	1	1.50659	Y	1	1.99622	A	1	1.99937	K	1	2.13316	W	1	2.523105	F	1	2.99005	G	1	2.99166	S	1	3.9595000000000002	V	1	4.4547799999999995	L	1	4.7043	T	1	5.530006666666666	D	1	5.9933	R	1	37.75754118253968
60		1	0	Q	1	0.0032133333333333332	Y	1	0.22158	H	1	0.35058	R	1	0.98448	C	1	0.99699	F	1	1	L	1	1.69025	K	1	2.60344	P	1	3.451775	G	1	3.7187500000000004	D	1	3.91708	N	1	4.444603333333333	S	1	5.63453	V	1	11.79474	A	1	16.026780547619047	TG	2	0.856135	GT	2	1.96543125
61		1	0	W	1	0.64966	F	1	0.76427	N	1	0.81414	R	1	0.96642	K	1	1.29766	P	1	1.3333333333333333	D	1	1.77576	L	1	1.79197	E	1	2.02515	Q	1	3.54907	A	1	3.666323333333333	T	1	4.05804	V	1	9.73006	S	1	23.75044804761905	GS	2	0.67359
62		1	0	L	1	0	R	1	0.07775	Y	1	0.083	E	1	0.2276	F	1	0.33290333333333333	A	1	0.7142857142857143	K	1	0.982	D	1	0.99983	S	1	0.99988	T	1	1.95011	Q	1	2.17685	N	1	2.6524	P	1	2.87395	V	1	12.509319999999999	G	1	29.584426583333336
63		1	0	R	1	0.79598	Q	1	0.84776	H	1	0.889	N	1	0.9282	K	1	0.99628	P	1	0.99966	F	1	0.99984	Y	1	1.99508	S	1	2.019672380952381	E	1	2.0288399999999998	L	1	3.5839100000000004	T	1	3.83805	G	1	3.99991	A	1	5.9966800000000005	V	1	24.053926000000004
64		1	0	T	1	0.34903	N	1	0.87584	H	1	0.99845	Y	1	0.99855	F	1	1.17515	D	1	1.4668857142857143	V	1	1.9998	M	1	2.46897	G	1	2.99586	L	1	3.74589	A	1	8.883610000000001	P	1	27.835677416666663
65		1	0	H	1	0	P	1	0	S	1	0.71353	L	1	0.99996	W	1	1.2653766666666666	T	1	1.65344	A	1	2.90289	V	1	3.8046100000000003	E	1	5.02611	G	1	7.27065	D	1	28.334505464285716
66		1	0	M	1	0.09191	Y	1	0.7142857142857143	D	1	0.87023	G	1	0.99777	S	1	0.99855	P	1	1.3333233333333334	V	1	1.34641	AV	1	1.746845	Q	1	1.9959099999999999	A	1	2.3638	L	1	3.04776	E	1	3.5325100000000003	F	1	4.900581666666667	R	1	19.708775749999994
67		1	0	E	1	0.19233	W	1	0.4776033333333333	P	1	0.7142857142857143	M	1	0.71546	L	1	1.127	V	1	1.68209	A	1	2.90887	D	1	6.939173333333334	F	1	22.903425
68		1	0	N	1	0.00565	M	1	0.43643	A	1	0.47218000000000004	T	1	0.95028	P	1	1.99685	E	1	2.24239	L	1	2.701365714285714	D	1	6.80197	Q	1	7.234696666666667	S	1	17.789997500000002
69		1	0	Y	1	0.32405	N	1	0.94423	L	1	0.95198	K	1	0.95738	M	1	0.98977	V	1	1.25609	T	1	1.28173	A	1	1.91001	S	1	1.98487	P	1	2.0386257142857143	G	1	38.376656754562255	SG	2	0.999295
70	G	1	0		1	0	N	1	0.15958	R	1	0.20389	M	1	0.33316	E	1	0.5549000000000001	V	1	0.6450066666666666	Q	1	0.78488	L	1	0.9881	C	1	0.99552	A	1	0.9992800000000001	F	1	0.99983	P	1	1.5	D	1	1.84087	T	1	2.59847	S	1	38.35854073123535
71		1	0	N	1	0	R	1	0.06264	Q	1	0.30481	M	1	0.31139	V	1	0.3333333333333333	D	1	0.8825	P	1	0.99837	K	1	1	Y	1	1.3168033333333333	A	1	1.7073257142857143	T	1	1.98493	F	1	1.99987	L	1	3.9220506666666664	S	1	18.289176308616305	G	1	20.362454833333338
72		1	0	D	1	0.2029	H	1	0.32304333333333335	M	1	0.63841	N	1	0.96603	W	1	0.99951	L	1	0.9999	Y	1	1	P	1	1	C	1	1.27894	Q	1	1.3112566666666665	T	1	1.36953	V	1	1.499955	E	1	2.586908	S	1	33.02166900263175	DS	2	0.32859166666666667
73	N	1	0		1	0	P	1	0	V	1	0.15362666666666666	A	1	0.599834	F	1	0.6535333333333333	K	1	0.82456	Q	1	0.97489	R	1	0.99916	Y	1	1.4958425	G	1	1.95483	L	1	2.3163133333333334	T	1	2.9742800000000003	S	1	3.32852	E	1	12.994918864922614	D	1	16.943130630952382
74	AV	1	0		1	0	V	1	0.33161666666666667	F	1	0.56402	VA	1	0.67577	D	1	0.87437	Y	1	0.9305	LG	1	0.999985	A	1	1.32765	R	1	1.59664	E	1	1.8893933333333333	P	1	1.98546	N	1	2.11593	S	1	2.1850899999999998	L	1	2.9332646666666666	T	1	2.99948	K	1	27.697147772580266
75		1	0	H	1	0.33294	Q	1	0.38171	V	1	0.54922	G	1	0.7501599999999999	T	1	0.94903	A	1	0.99167	C	1	0.99499	K	1	0.99883	Y	1	1.23423	N	1	1.3286666666666667	E	1	2.26293	L	1	13.67796455185955	D	1	14.90949046428571	FD	2	0
76	Y	1	0		1	0	R	1	0	W	1	0.599702	P	1	0.97298	S	1	0.99961	K	1	1.06365	E	1	1.33026	D	1	1.7300300000000002	G	1	2.48194	L	1	8.141883666666667	F	1	12.614674047619047	Q	1	12.848001162219914	TF	2	0.9119200000000001
77		1	0	V	1	0	E	1	0.17866	D	1	0.35131	Y	1	0.99944	R	1	1	P	1	1.3332700000000002	Q	1	2.133037166666667	S	1	3.29803	L	1	3.462504666666667	T	1	12.096216583333334	K	1	16.020613425733426	KTL	3	0.9355600000000001
78	Y	1	0	N	1	0		1	0	K	1	0.11375	D	1	0.82136	Q	1	0.95533	S	1	0.99918	T	1	0.99988	P	1	3.365749	L	1	38.26918109014783
79		1	0	A	1	0.33332333333333336	H	1	0.75834	E	1	0.99322	Y	1	0.99978	P	1	0.99993	N	1	1.3143566666666666	G	1	1.3332233333333334	M	1	1.748095	S	1	1.99667	T	1	2.5659975	V	1	3.769007	L	1	3.9823999999999997	K	1	13.357783333333334
80	N	1	0	V	1	0	M	1	0	A	1	0		1	0	C	1	0.07412	S	1	0.99832	P	1	0.99993	Q	1	1	L	1	28.581302249999997	VT	2	0	SL	2	1.0533233333333332
81		1	0	F	1	0.33332	L	1	0.33332666666666666	Q	1	0.87583	N	1	0.91813	E	1	0.93081	T	1	0.992	A	1	1.18738	V	1	2.3312333333333335	G	1	2.50316	S	1	12.749062333333333
82		1	0	G	1	0.33332666666666666	N	1	0.45596666666666663	T	1	0.74933	E	1	0.99053	Q	1	1	L	1	1.922335	K	1	2.006326666666667	GL	1	3.2885925	R	1	9.62259	VR	2	0.789295
83	W	1	0	Y	1	0		1	0	A	1	0.99898	R	1	2.2708525	L	1	2.3572075	V	1	17.613333333333337	DL	2	0.9201950000000001	LD	2	2.5156183333333333
84	M	1	0		1	0	D	1	0.10022	Q	1	0.28858	A	1	0.9952	G	1	0.99991	F	1	1.3328366666666667	S	1	1.51197	T	1	1.6354766666666667	E	1	12.829730000000001
85	Y	1	0		1	0	F	1	0.14444	M	1	0.33629	S	1	0.48743	P	1	3.1349725	L	1	3.33265	T	1	18.012356666666665
86		1	0	S	1	0.97299	V	1	1	L	1	1.2725533333333332	Y	1	2.6187775	E	1	18.41499333333333
87		1	0	S	1	0.92656	K	1	0.9876	P	1	0.99912	A	1	0.99949	E	1	1	L	1	1.3088	D	1	21.496867499999997
88		1	0	T	1	0.92809	G	1	0.9998	S	1	0.99994	K	1	1.3301733333333332	L	1	1.67063	V	1	19.198630833333333
89	L	1	0.19548	N	1	0.37108	H	1	0.82342	A	1	1	V	1	1	G	1	20.987193333333334
90		1	0	G	1	0.66558	V	1	0.99995	R	1	1.88388	T	1	20.738875833333335
91		1	0	D	1	0.43578	G	1	0.9976	T	1	0.99958	E	1	1	F	1	1	A	1	1.98086	Y	1	17.506765
92		1	0	M	1	0.09945	N	1	0.55899	G	1	0.99987	K	1	1	Y	1	18.390128333333333	CY	2	0.62834
93		1	0	E	1	0.52013	T	1	0.68186	D	1	0.76161	H	1	0.99404	M	1	1.52182	A	1	1.8918499999999998	S	1	3.96056	C	1	7.620863611111111	MC	2	0.610715
94		1	0	A	1	0.03227	N	1	0.62173	K	1	0.83671	D	1	0.86522	C	1	0.96871	P	1	0.9942	E	1	1.79719	M	1	9.010226944444444	GVC	2	0.70229
95		1	0	V	1	0.06879	R	1	0.43768	GA	1	0.600965	T	1	0.6528	M	1	2.72093	Q	1	13.888604087301587
96		1	0	E	1	0.3118	L	1	0.91042	R	1	0.97253	D	1	1.6259700000000001	G	1	17.497881746031744
97		1	0	D	1	0.25981	E	1	0.54178	Q	1	0.61216	P	1	0.78022	K	1	0.97144	S	1	1.4803125000000001	V	1	1.8998	L	1	2.57965	R	1	11.762358095238097
98		1	0	D	1	0.31646	Y	1	0.8356	A	1	0.9329799999999999	S	1	1	R	1	2.046686388888889	Q	1	4.4836599999999995	E	1	10.22872657142857
99		1	0	E	1	0.812381388888889	D	1	0.87197	T	1	2.27242	M	1	2.9836400000000003	S	1	13.690866095238096
100		1	0	F	1	0.07364	G	1	3.86346	P	1	17.671965071428573
101		1	0	M	1	0.77495	AM	1	0.851145	L	1	0.99947	F	1	1	S	1	1.6246116666666666	W	1	15.629420055555554
102		1	0	L	1	2.98755	T	1	36.2411902631579
103		1	0	N	1	0.99642	S	1	2.9886299999999997	F	1	35.29437302005014
104	Q	1	0.28476	W	1	0.99805	F	1	0.9987	A	1	0.99992	H	1	1.29328	G	1	37.087062807017546
105		1	0	S	1	0.4988975	F	1	0.77138	G	1	0.99997	E	1	2.95509	Q	1	31.582275273182955
106	S	1	0.3314533333333333	G	1	37.143423139097735	TG	2	1.74678	SA	2	4.69398
107	G	1	0.15514333333333333	H	1	0.61321	S	1	0.70512	Y	1	0.96152	D	1	3.3598600000000003	T	1	29.32247334210526
108	AV	1	0.83336	Q	1	0.95659	D	1	0.97491	E	1	1.36486	L	1	1.49381	P	1	1.4989575	K	1	36.82147239348371
109	L	1	0.05075333333333334	E	1	0.28436	R	1	0.91747	K	1	2.09918	V	1	34.44416323934838
110	K	1	0.65971	R	1	0.9209	N	1	0.99567	L	1	0.99895	V	1	1.99648	D	1	32.889434348370926	LD	2	0
111	T	1	0	N	1	0.31237	R	1	0.3599	D	1	0.49333000000000005	V	1	0.77522	W	1	0.79803	A	1	0.99993	K	1	3.31991	L	1	30.810321904761896
112		1	0	E	1	0	D	1	0.25624	M	1	0.39526	GL	1	0.5245299999999999	R	1	0.99545	V	1	0.99888	N	1	0.99948	A	1	0.99989	G	1	1.46113	L	1	1.7820233333333335	K	1	25.086725701754386
113	L	1	0.08485	GL	1	0.5389775	N	1	0.63419	E	1	0.85768	T	1	0.9796	A	1	0.99931	K	1	3.00581	V	1	3.2981100000000003	R	1	15.940822017543859
114	A	1	0	E	1	0.02822	D	1	0.5045474999999999	V	1	0.76217	F	1	0.93998	K	1	0.99986	L	1	1.08468	N	1	1.13987	T	1	1.5951620000000002	G	1	2.44192	S	1	13.000246842105264	TV	2	2.4765042307692307
115	D	1	0.12389	N	1	0.33493	F	1	0.9924	T	1	1.4203805	G	1	1.61459	L	1	12.150743388157895
116	P	1	0		1	0	R	1	0.039259999999999996	V	1	0.36532	D	1	0.99445	L	1	0.99977	A	1	15.540663633097166
117	R	1	0		1	0	K	1	0.87482	F	1	0.87777	T	1	0.98418	G	1	0.99981	L	1	1.86946375	A	1	15.54321201754386	PSA	3	0.39653133333333335
118		1	0	F	1	0	V	1	0.67395	T	1	0.99999	A	1	1.874585625	S	1	2.298396666666667	P	1	15.237023180386867
119		1	0	Q	1	0.24465	C	1	0.3333333333333333	K	1	0.874978125	A	1	0.99812	V	1	1.2001400000000002	E	1	2.832031111111111	F	1	3.4959308333333334	S	1	8.524940748987854	VS	2	0.5891850000000001
120		1	0	T	1	0.82435	D	1	0.94361	S	1	0.96813	G	1	0.99845	N	1	0.99943	V	1	16.684264942645076
121		1	0	M	1	0.331302	V	1	0.55443	K	1	0.84575	D	1	0.99975	S	1	0.99979	L	1	1.1619933333333332	F	1	17.064014546759175
122		1	0	F	1	0.3333333333333333	G	1	0.36575	K	1	0.8108908333333334	D	1	0.84201	P	1	0.9947	V	1	1.19169	L	1	8.877856943495862
123		1	0	W	1	0.83353	R	1	0.96978	E	1	0.99955	P	1	1.59864	F	1	10.974670236167341
124	G	1	0	H	1	0		1	0	D	1	0.3333333333333333	S	1	0.6	R	1	0.99398	N	1	0.9947	P	1	11.703986829783487
125	V	1	0		1	0	K	1	0.26085	E	1	0.3333333333333333	A	1	0.6	S	1	0.97445	T	1	0.999	P	1	11.60343102681453
126	M	1	0		1	0	L	1	0.8252533333333334	K	1	0.99993	E	1	1.98893	S	1	11.687336124655287
127		1	0	H	1	0.8397470833333331	N	1	0.96219	T	1	0.97184	V	1	0.9966	S	1	0.99761	F	1	0.99983	P	1	0.99991	D	1	10.742730423546325
128	A	1	0.22195	G	1	0.6418025	K	1	0.95655	L	1	0.9969	S	1	1.3323233333333333	E	1	11.648990199825441	QE	2	0.6398550000000001
129	E	1	0.32920187500000003	A	1	0.42752	AG	1	0.7632749999999999	L	1	0.9223989583333334	M	1	0.93556	S	1	0.99961	P	1	1	Q	1	10.739702398932113
130	T	1	0.90491	V	1	0.97796	P	1	0.99697	G	1	1	A	1	1.3328133333333334	L	1	16.707199681430794	KL	2	4.743473
131	C	1	0	Q	1	0	R	1	0.75543	P	1	0.875	V	1	0.94045	E	1	0.98673	A	1	0.99986	S	1	0.99997	G	1	0.99999	T	1	1	F	1	1.30291	L	1	2.693625416666667	K	1	9.916048131490935
132	C	1	0	Q	1	0.3296766666666667	M	1	0.87497	G	1	1.86574	A	1	1.97981	L	1	2.2291333333333334	T	1	6.710883333333334	S	1	47.36665166194968	GS	2	0.890995
133	T	1	0.2776133333333333	S	1	0.34789	R	1	0.92427	C	1	0.99605	N	1	0.99803	A	1	3.722814756289308	E	1	4.7320633333333335	Q	1	15.581718888888888	G	1	26.239122625	AS	2	5.200102
134	K	1	0		1	0	A	1	0.07665999999999999	Q	1	0.24167	E	1	0.93041	P	1	0.96384	G	1	0.99702	N	1	1.1833777083333334	D	1	2.2572799999999997	S	1	7.09554	T	1	41.144502996855344
135		1	0	G	1	0.05722333333333333	Y	1	0.69567	L	1	0.94078	N	1	2.37588	P	1	2.9998199999999997	V	1	15.664990000000001	A	1	42.98578992872117	GT	2	1.8436949999999999	VGT	3	2.86231
136		1	0	N	1	0.1046	F	1	0.24136	Q	1	0.70219	W	1	0.97879	G	1	0.99959	P	1	0.99984	L	1	1	A	1	1.99985	E	1	2.2679333333333336	S	1	56.71183211006289
137	Q	1	0.12159	N	1	0.14617	R	1	0.68196	D	1	0.77086	T	1	1.99905	L	1	2.3291033333333333	G	1	7.5351122909699	F	1	8.877711588050314	A	1	15.912580000000004	V	1	36.681078472222225
138	R	1	0.2046	K	1	0.87873	T	1	0.93459	S	1	0.99655	G	1	1.62802	N	1	1.75229	P	1	1.83617	L	1	3.6077966666666663	V	1	58.25265912105166	AM	2	0.42413500000000004	CV	2	1.9976
139	M	1	0		1	0	H	1	0.17894	Q	1	0.45365	P	1	0.9999	F	1	1	A	1	1.21868	D	1	1.3119033333333334	V	1	1.7851	K	1	1.9988299999999999	T	1	2.36434	G	1	2.61648	R	1	2.83203	S	1	4.3257433333333335	L	1	7.881485765050168	C	1	35.10646305555556
140		1	0	K	1	0	G	1	0	E	1	0.00728	R	1	0.12315	N	1	0.31221	F	1	0.51459	Q	1	0.56503	D	1	0.93176	T	1	0.98054	C	1	1	H	1	1.6667	V	1	2.8123899999999997	L	1	53.2406048734671
141		1	0	M	1	0.28289	Y	1	0.33054333333333336	Q	1	0.39383999999999997	T	1	0.41838	E	1	0.97057	R	1	1.2594966666666667	N	1	1.70784	S	1	1.99892	H	1	4.66955	G	1	4.9691600000000005	P	1	6.287034444444444	L	1	39.197977876254186	VAG	2	1.9415300000000002
142	A	1	0		1	0	M	1	0	L	1	0.78188	P	1	0.81217	GG	1	0.842835	T	1	0.90532	Q	1	0.99465	Y	1	1.14777	R	1	1.2286233333333332	G	1	1.4341	E	1	1.45595	V	1	1.63211	S	1	5.855731111111111	D	1	13.455574416666666	N	1	28.396081756317358
143		1	0	H	1	0	S	1	0.4536766666666667	Y	1	0.50087	C	1	0.60006	V	1	0.79563	F	1	0.99836	L	1	1.26117	M	1	1.98729	P	1	1.99099	E	1	2.9695	G	1	2.99985	A	1	3.0568388888888887	GG	1	4.689509999999999	D	1	4.9656666666666665	N	1	26.306102962560384	FN	2	0.7030350000000001
144		1	0	Y	1	0.16068	Q	1	0.33292	E	1	0.47985999999999995	M	1	0.63461	V	1	0.80543	G	1	0.9037	K	1	0.99766	N	1	1	H	1	1.04775	L	1	1.5483699999999998	A	1	1.6029499999999999	D	1	1.7757066666666665	W	1	1.99871	P	1	2.91008	T	1	3.1877476811594208	S	1	4.278473333333333	F	1	23.588146333333338	YF	2	0.45146
145		1	0	L	1	0.1267	M	1	0.61808	R	1	0.64361	G	1	0.85513	E	1	0.94979	T	1	1.12181	S	1	1.25823	A	1	2.3338541666666663	N	1	2.89113	D	1	3.352603333333333	H	1	3.9232199999999997	Y	1	27.777648833333338
146		1	0	M	1	0.17854	N	1	0.95233	S	1	0.98007	R	1	0.98671	Y	1	0.9923	H	1	0.9983	L	1	0.99988	F	1	1.2325	D	1	1.96391	C	1	1.9861300000000002	W	1	1.99208	P	1	33.22531333333333	RP	2	0.520485
147		1	0	M	1	0.25797	S	1	0.38498	T	1	0.98277	K	1	0.99998	L	1	0.99998	F	1	1.2562825000000002	Y	1	1.39303	E	1	1.51036	D	1	2.3634	R	1	25.839196166666675
148	D	1	0.6556	A	1	0.75457	G	1	0.98641	L	1	1.4973100000000001	R	1	2.28224	E	1	6.15049
149	V	1	0	N	1	0.18285	P	1	0.21334	L	1	0.24839	M	1	0.44964	T	1	0.65612	A	1	12.3665
150	T	1	0	Y	1	0.11665	S	1	0.25475	M	1	0.39787	H	1	0.60844	VA	1	0.9787399999999999	K	1	4.1890149999999995	L	1	4.46655
151	H	1	0	Y	1	0.93859	V	1	14.681379523809523
152	S	1	0.43944	D	1	0.95409	G	1	0.99961	F	1	1.498945	L	1	1.99463	N	1	3.98053	Q	1	6.6425230952380945
153	G	1	0	MA	1	0.82114	T	1	0.94816	D	1	0.96646	A	1	0.97557	N	1	0.98558	E	1	1.6806342857142857	Q	1	1.948079047619048	W	1	7.204949999999999
154		1	0	L	1	0	D	1	0.35256	H	1	0.8587	LG	1	0.869815	Q	1	0.99484	A	1	0.99972	K	1	15.46000380952381
155	T	1	0.4801	Q	1	0.7967	M	1	0.86355	A	1	0.9888	S	1	1.553964523809524	Y	1	1.7680500000000001	L	1	4.49326	V	1	13.793449047619049
156	S	1	0.21961999999999998	C	1	0.3964	A	1	0.62612	Y	1	0.6710197619047623	L	1	0.99357	G	1	0.99853	Q	1	0.99989	K	1	1.34702	E	1	3.4288666666666665	D	1	16.495935238095235
157	Q	1	0.00471	Y	1	0.10164	E	1	0.18799	R	1	0.85853	H	1	0.97526	P	1	1.3333033333333333	D	1	1.51205	M	1	2.38677	L	1	2.99796	A	1	2.99815	N	1	11.726765952380951	GQ	2	2.721545
158	H	1	0.01939	V	1	0.27337	D	1	0.56743	R	1	0.96679	T	1	0.98909	M	1	0.99229	F	1	0.99987	Q	1	1.11453	A	1	17.20958857142857
159		1	0	G	1	0.9065	T	1	0.9762	C	1	1.99979	L	1	31.43992476190476
160	N	1	0		1	0	S	1	0.56181	A	1	1.89579	L	1	1.98498	V	1	2.71237	C	1	3.9851900000000002	Q	1	22.547891428571422
161		1	0	K	1	0.3252466666666667	V	1	0.90495	C	1	0.96363	G	1	0.98124	E	1	0.99762	M	1	0.99992	T	1	1	P	1	1.99963	N	1	2.1708	A	1	3.9536	S	1	18.824282857142855
162		1	0	M	1	0.18268428571428572	P	1	0.98119	S	1	0.99949	A	1	1	D	1	1.0469466666666667	V	1	1.9131200000000002	G	1	24.608255714285715
163	C	1	0.09036	F	1	0.16584333333333331	E	1	0.49152	K	1	0.96591	P	1	0.99877	GG	1	1.040195	L	1	1.9495399999999998	A	1	2.96357	D	1	3.2585800000000003	V	1	5.131923333333334	N	1	14.03062761904762
164		1	0	G	1	0.14575	Q	1	0.59827	K	1	0.95638	Y	1	0.9983	P	1	0.99997	T	1	1	L	1	1	E	1	1.62194	V	1	4.8767804761904765	S	1	24.881304285714283
165		1	0	T	1	0	M	1	0.98118	L	1	0.99564	H	1	0.99693	P	1	1	R	1	1	E	1	1.1133899999999999	V	1	1.3333066666666666	S	1	1.99933	G	1	5.226563333333333	Q	1	17.341228095238097
166	C	1	0.13527	H	1	0.74478	T	1	0.99995	G	1	1	L	1	1.3319933333333334	A	1	1.3332600000000001	D	1	1.72546	S	1	1.88378	W	1	1.99868	P	1	2.41065	Q	1	2.4883442857142857	V	1	4.660620000000001	E	1	12.753284285714287
167	D	1	0.47152	Q	1	0.98824	L	1	0.99973	R	1	1	E	1	1.6190799999999999	V	1	2.53077	T	1	2.649094285714286	G	1	4.11545	S	1	21.213231904761905
168		1	0	Q	1	0.34586	T	1	0.99629	C	1	0.99918	P	1	1	E	1	1.3313533333333334	S	1	1.99899	L	1	3.43536	V	1	19.881626984126985	LS	2	0.99992
169		1	0	F	1	1.3111	S	1	1.7493522222222224	D	1	1.84991	M	1	1.89501	P	1	1.9981499999999999	T	1	21.925057619047617
170	Q	1	0		1	0	C	1	0.43703	V	1	0.57152	S	1	0.9585	Y	1	0.97153	A	1	0.99659	G	1	0.99928	F	1	0.99985	T	1	1	L	1	1.19081	D	1	1.7636266666666667	H	1	1.97981	E	1	19.0613119047619
171	F	1	0	P	1	0		1	0	G	1	0.1147	GA	1	0.547075	L	1	0.62061	N	1	0.99974	Y	1	0.99989	T	1	1	D	1	1.4993199999999998	E	1	2.14197	Q	1	19.417038888888893	NE	2	0.28125	EN	2	0.973385
172	T	1	0	K	1	0		1	0	N	1	0.06370999999999999	F	1	0.33320333333333335	E	1	0.46672	L	1	0.593998	M	1	0.7716	S	1	1	G	1	1.3316733333333333	V	1	5.95113	D	1	20.31751777777778
173		1	0	N	1	0.53119	D	1	0.91143	Q	1	0.96328	K	1	1.07246	E	1	1.2239	G	1	1.31407	L	1	2.99605	V	1	4.223	T	1	4.362410000000001	S	1	46.70533707382798
174		1	0	D	1	0.16911	V	1	0.21123	G	1	0.33012	Q	1	0.46507	H	1	0.98606	R	1	0.99459	GL	1	0.99491	P	1	0.99998	T	1	1	L	1	1.7433	Y	1	2.55412	S	1	2.890153333333333	VA	1	3.9953550000000004	N	1	6.083145666666667	K	1	41.067848241853746	DK	2	0.492055
175		1	0	V	1	0.23344	F	1	0.37844	A	1	0.40657888888888893	L	1	0.6687	K	1	0.7377066666666667	H	1	0.73794	N	1	0.86487	W	1	0.99949	T	1	1	P	1	1.8139118181818181	E	1	1.94971	S	1	3.1802479999999997	G	1	9.23837	Y	1	16.684415271317828	D	1	24.71977013636364
176		1	0	T	1	0.46072	M	1	0.5001545454545455	Q	1	0.80378	V	1	0.81694	F	1	0.8720497777777778	A	1	0.96661	C	1	0.98402	G	1	1.49826	P	1	1.91521	Y	1	2.078606666666667	K	1	3.15466	L	1	5.543294666666665	D	1	6.581089999999999	E	1	6.983099583333333	N	1	8.071863516057586	S	1	25.28092152146465
177		1	0	M	1	0.61846	Q	1	0.96531	K	1	0.9944755555555556	Y	1	1.19565	G	1	1.23101	F	1	1.9875099999999999	V	1	2.89215	N	1	4.095203333333333	L	1	5.77353	D	1	7.171046363636364	S	1	15.411380404761905	T	1	29.003765685606066
178		1	0	M	1	0.22698	Q	1	0.34418	K	1	0.76492	P	1	0.93174	H	1	1	N	1	1.5536685714285714	A	1	1.68634	E	1	1.9657200000000001	S	1	2.19311	G	1	2.4639975	V	1	2.5965000000000003	D	1	2.9906699999999997	Y	1	19.37815600631313	L	1	41.78224261741165
179		1	0	N	1	0.14841	G	1	0.29880666666666666	M	1	0.75653	P	1	0.99393	D	1	1.564346	E	1	2.18212	Q	1	2.98172	S	1	25.072280247294366	T	1	58.41504850617087
180		1	0	S	1	0.05716	Q	1	0.66354	R	1	0.87102	D	1	0.99923	A	1	1	G	1	4.25974	L	1	89.54094580483851
181		1	0	R	1	0.42472	V	1	0.7138171428571428	Y	1	0.78054	P	1	0.99989	H	1	1	G	1	2.45826	E	1	2.548286	A	1	2.8400100000000004	D	1	4.13746	L	1	4.19886	T	1	7.180807714285715	S	1	22.700152312229434	N	1	42.95833086764863
182		1	0	Y	1	0.21304	P	1	0.99921	A	1	1	H	1	1	T	1	1.3039366666666665	G	1	2.1351128571428575	E	1	3.792318	D	1	6.061062916666667	L	1	13.826545476190477	S	1	23.928387012987013	N	1	44.043878341042884
183		1	0	E	1	0.6412628571428572	M	1	0.8403719999999999	W	1	0.89203	R	1	0.93371	H	1	0.99222	F	1	1	P	1	1	G	1	1.4578025000000001	A	1	1.54895	K	1	1.69573	S	1	1.99163	L	1	2.6366965	N	1	7.125822982456142	T	1	18.686314017857146	D	1	43.30210089565365
184	V	1	0.64582	Y	1	0.99997	G	1	1	E	1	1.29259	N	1	1.4519833333333332	S	1	1.7999295	D	1	2.18315	A	1	2.2991666666666664	L	1	94.11093756385505
185	Q	1	0		1	0	M	1	0.10669	N	1	0.15219	Y	1	0.19362	G	1	0.48790500000000003	V	1	0.7296	S	1	0.93322	C	1	0.99959	A	1	1.0999430000000001	H	1	1.4619974999999998	P	1	1.9288906666666665	L	1	3.8448157142857147	K	1	3.9820699999999998	D	1	4.317243333333334	T	1	88.01372815378991
186	Q	1	0	V	1	0	H	1	0		1	0	D	1	0.495185	S	1	0.5	P	1	0.8	N	1	0.99591	G	1	0.99697	E	1	1.6698835	K	1	1.7105428571428571	T	1	1.90755	L	1	98.38163022211843
187	M	1	0	F	1	0		1	0	G	1	0.7999930000000001	D	1	0.93191	Y	1	0.96687	H	1	0.98257	N	1	0.99563	C	1	1.499965	E	1	2.304055	K	1	2.97613	Q	1	2.99755	T	1	3.3099133333333333	V	1	4.0432185	S	1	17.172995943181817	L	1	60.508205165953555
188		1	0	W	1	0	H	1	0.21887500000000001	G	1	0.62718	V	1	0.7999090000000001	T	1	0.88804	S	1	0.94405	A	1	1	N	1	1.87036	L	1	4.50283	K	1	58.33869605255211
189		1	0	D	1	0.09338	Y	1	0.22986	G	1	0.94792	P	1	0.97479	N	1	1.73454	S	1	2.16227	L	1	2.28866	K	1	3.2970025	A	1	13.712420606060608
190		1	0	N	1	0	S	1	0.69619	A	1	0.85358	D	1	0.8808406666666666	K	1	0.89544	H	1	1	E	1	1.1676600000000001	T	1	1.43117	L	1	1.49491	R	1	1.60508	Q	1	2.417866	Y	1	5.2981525000000005
191	G	1	0	M	1	0.57318	E	1	0.5915	W	1	0.86716	A	1	0.97313	L	1	0.99438	C	1	1	D	1	2.52699	Y	1	9.161358166666668
192	R	1	0	A	1	0	S	1	0.5	Y	1	0.95478	N	1	0.96518	V	1	0.99386	D	1	1.77078	E	1	4.002878833333334	GVT	2	1
193	Q	1	0.03288	L	1	0.498745	T	1	0.5	E	1	0.5381	D	1	2.53091	K	1	6.328924666666666	HK	2	0.97959
194	A	1	0.49146500000000004	P	1	0.5	G	1	0.84271	D	1	1	L	1	3.5884620000000003	H	1	8.831472
195	G	1	0.5	GL	1	0.727815	C	1	1	A	1	2.598082	K	1	10.259780333333332
196	Y	1	0.53141	Q	1	2.5947	V	1	28.41129615686275	YV	2	2.717315
197	F	1	0.49039999999999995	P	1	1.9945599999999999	K	1	2.58759	V	1	3.99623	Y	1	23.147377764705876
198		1	0	N	1	0.09182	E	1	0.91478	V	1	0.9745866666666667	S	1	0.99509	G	1	1.3489200000000001	M	1	1.99378	A	1	22.471788904977377	CA	2	0.85318
199	T	1	0.37173	S	1	0.51966	Y	1	0.85018	E	1	1	A	1	1.16911	D	1	1.3706266666666667	L	1	1.99999	G	1	5.29147	C	1	13.53909473906486
200		1	0	M	1	0.09993	A	1	0.25378666666666666	N	1	0.27355	C	1	0.6223799999999999	G	1	0.87485	Q	1	0.99763	S	1	1	D	1	1.3012233333333334	E	1	17.78079390950226	DL	2	0.48207
201		1	0	L	1	0.09807	A	1	0.11674	C	1	0.26645	W	1	0.28076	M	1	0.29527	E	1	0.3753266666666667	N	1	0.53123	Y	1	0.5719166666666666	K	1	0.8349	P	1	0.99969	F	1	1.2680099999999999	V	1	15.999905024132733
202		1	0	W	1	0.1926075	N	1	0.5629	G	1	0.94149	V	1	0.99917	P	1	0.99998	M	1	1	A	1	1.10493	D	1	3.16974	T	1	25.274935586727
203		1	0	Y	1	0.11134	V	1	0.93374	K	1	0.94541	A	1	0.99316	L	1	0.9989	D	1	1	T	1	1.97525	H	1	27.51195900603318
204		1	0	C	1	0.3156975	AG	1	0.77746	R	1	0.98783	L	1	0.98857	T	1	0.99189	E	1	1.20706	P	1	1.87535	A	1	1.98837	V	1	2.29576	Q	1	33.01715612971343	GQ	2	0.5462400000000001	AN	2	0.594895
205		1	0	Y	1	0	S	1	0.99775	T	1	0.99999	V	1	1	Q	1	1.09101	A	1	1.91742	P	1	2.3332533333333334	G	1	35.02771508446457	VA	2	0.339511	AV	2	2.430025
206	E	1	0.19987	Q	1	0.3034	K	1	0.57321	P	1	0.65451	D	1	0.94921	N	1	1	V	1	1.94381	T	1	2.6	A	1	3.0751833333333334	S	1	3.5946800000000003	L	1	33.08855386251657	VT	2	0.4660425	SL	2	0.505375
207	G	1	0.38896	A	1	0.63654	Q	1	0.97719	V	1	1.73551	L	1	3.1103144444444446	E	1	3.4987100000000004	T	1	4.3078199999999995	S	1	37.74789460226049
208		1	0	R	1	0	P	1	0.86634	N	1	0.96273	Y	1	0.99568	L	1	2.4112299999999998	V	1	2.448235	T	1	3.3580275	Q	1	4.061906666666667	E	1	5.300771161319612	S	1	36.196799288162815
209	A	1	0	T	1	0.17031	H	1	0.82636	V	1	0.99995	D	1	1.09198	E	1	2.16865	L	1	6.020893333333333	P	1	53.34445996834814	VP	2	0.8785149999999999
210	L	1	0	E	1	0.14522666666666667	M	1	0.99903	K	1	1.4255499999999999	Q	1	3.9117699999999997	A	1	15.20420649062069	V	1	37.64226123223182	SL	2	2.335285	LS	2	3.60461
211	R	1	0.90332	S	1	0.99428	V	1	1.017	N	1	1.99297	D	1	4.44623	L	1	5.868598333333333	T	1	42.10165974290078
212		1	0	Q	1	0.04907	S	1	0.28804	H	1	0.91213	GL	1	0.961365	E	1	0.99722	M	1	0.99813	LG	1	0.99902	R	1	1.96481	N	1	2.3222300000000002	V	1	2.830901875	L	1	6.255062727272727	G	1	7.623911398207451	K	1	26.42167979314803
213		1	0	G	1	0	W	1	0	E	1	0.24186	R	1	0.6	C	1	0.73473	N	1	0.8155445454545455	A	1	0.97408	D	1	0.98834	K	1	0.99287	V	1	1	T	1	12.968100879038763	S	1	18.910153432539687	GS	2	0
214		1	0	V	1	0.6	M	1	0.66557	L	1	0.680235	T	1	0.93516	P	1	0.99765	K	1	0.99847	S	1	0.99988	R	1	1.95448	F	1	3.088228571428571	G	1	23.527864412567144
215	A	1	0	M	1	0.8530914285714286	H	1	0.8595	P	1	0.8723593749999999	T	1	0.99446	G	1	0.9995	K	1	1.0939733333333335	R	1	1.445061875	S	1	1.5077990000000001	W	1	1.8712965828321488	F	1	4.09692	L	1	16.88474638888889	RL	2	0.63513
216	K	1	0	S	1	0.29642	H	1	0.75622	N	1	0.92446	A	1	0.9873035416666668	R	1	11.555994091609389	MR	2	0.675555
217	T	1	0	A	1	0	W	1	0.06006	S	1	0.8214414285714285	N	1	0.88156	F	1	0.95547	M	1	1.9962684583333334
218	C	1	0.29565	E	1	1.14851
219	C	1	2.86138

Variant Graph

Determine stroke width:

LocalGlobal

Higher Order Variant Graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence

Label	Value
"0"	33.3
""	40.2
""	46.7
""	55.7
""	51
""	44.3
""	50.7
""	62
""	52.8
""	66.9
""	63.1
""	67.2
""	58
""	62.2
""	67.4
""	61.3
""	52.4
""	67.2
""	65
""	81.1
"20"	73.2
""	74.8
""	63.8
""	59.9
""	43.9
""	41.4
""	41.2
""	51.9
""	55.3
""	60
""	47.9
""	45
""	38
""	39.3
""	22.8
""	22.8
""	26.2
""	17.6
""	16.3
""	13
"40"	11
""	17
""	19.2
""	15.8
""	14.2
""	20.4
""	25.2
""	24.6
""	45.6
""	51.8
""	59.2
""	78.1
""	81.2
""	86.5
""	89.1
""	91.9
""	87.6
""	82.9
""	82.6
""	80.2
"60"	59.7
""	56.8
""	56.2
""	54
""	53.8
""	52
""	43.6
""	37.7
""	40.6
""	52
""	51
""	53.5
""	47.5
""	46.2
""	49.1
""	39.4
""	43.7
""	41.8
""	45.5
""	34.2
"80"	32.7
""	23.2
""	21.2
""	26.7
""	19.7
""	25.4
""	24.3
""	27.7
""	25.1
""	24.4
""	24.3
""	23.9
""	21.7
""	18.6
""	15.8
""	18.4
""	21.3
""	20.9
""	19.8
""	20.6
"100"	21.6
""	20.9
""	39.2
""	39.3
""	41.7
""	36.8
""	43.9
""	35.1
""	43.9
""	37.8
""	38.5
""	37.9
""	33.5
""	26.3
""	25
""	16.6
""	17.9
""	21.5
""	21.1
""	19.1
"120"	21.4
""	22
""	13.4
""	15.4
""	14.6
""	14.8
""	15.5
""	17.5
""	16.4
""	16.1
""	26.7
""	21.5
""	62.2
""	59
""	54.9
""	70.4
""	66
""	75.1
""	72.5
""	64.1
"140"	62.2
""	64.4
""	58.9
""	54.3
""	47.7
""	45.9
""	47
""	36
""	12.3
""	14.1
""	11
""	15.6
""	16.5
""	15.5
""	19.5
""	24.7
""	26.2
""	27.8
""	23.1
""	35.3
"160"	33.7
""	33.1
""	30.7
""	31.1
""	37.1
""	32
""	33.5
""	35.6
""	31
""	30.7
""	30.9
""	28.6
""	30.8
""	64.3
""	65
""	63.6
""	66.5
""	71.3
""	79.9
""	92.4
"180"	97.4
""	92.9
""	98.3
""	84.7
""	106
""	108
""	107
""	99.5
""	69.2
""	25.4
""	17.7
""	16.7
""	10.2
""	11.4
""	15.3
""	15.1
""	34.3
""	32.2
""	29.6
""	26.1
"200"	23.7
""	21.6
""	34.2
""	34.5
""	45.6
""	46.1
""	49
""	52.4
""	56.6
""	65.5
""	65.3
""	57.3
""	52.6
""	38.2
""	34.4
""	32.1
""	15.2
""	4.71
""	1.44
""	2.86

Scores

Length	Score	Matches	Unique Score	Unique Matches
220	5.928E+04	1038	0	0

Order

IGKV2-28 → IGKJ1 → IGKC

Alignment

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210

DIVLTQ-SP-HSLSVT-PGESASI--S--CKSSH--SL-LHSNGYNYLDWYLQVKPSQ-SP-QL-L--I-YL--GSSRA-S----GVPD-RF---S----GSGSDKDFTLKISRVETE-DVGTYYCM-QGRQTPW-TFGQGT--K--VD-I-KRSLAA--PSVFI--FPPS-DEQLK-SGT-AS-VVC-L--L--NNFY-PRE--AKVQWKVDNA-LQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY-SL-SS--T-L-TLSK--AYYEKHKVYA-C-E-V--THQGLS-SP-VT-KSG--LRMEC

C154

Type	Read
Score	51
Start on Template	56
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C187

Type	Read
Score	48
Start on Template	55
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C109_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C189

Type	Read
Score	39
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C190

Type	Read
Score	48
Start on Template	9
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C193

Type	Read
Score	57
Start on Template	55
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_062

Type	Read
Score	53
Start on Template	159
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C549_002

Type	Read
Score	49
Start on Template	41
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C553

Type	Read
Score	45
Start on Template	41
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C90

Type	Read
Score	46
Start on Template	201
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_079

Type	Read
Score	40
Start on Template	11
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C544

Type	Read
Score	56
Start on Template	41
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_085

Type	Read
Score	42
Start on Template	41
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3509

Type	Read
Score	100
Start on Template	81
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C105_002

Type	Read
Score	74
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C116_003

Type	Read
Score	101
Start on Template	99
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1138

Type	Read
Score	62
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C102_003

Type	Read
Score	89
Start on Template	82
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_050

Type	Read
Score	74
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C489

Type	Read
Score	48
Start on Template	41
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_054

Type	Read
Score	87
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_076

Type	Read
Score	96
Start on Template	98
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C436

Type	Read
Score	44
Start on Template	159
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_071

Type	Read
Score	136
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C160_003

Type	Read
Score	116
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_072

Type	Read
Score	95
Start on Template	82
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_077

Type	Read
Score	114
Start on Template	98
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C193_002

Type	Read
Score	86
Start on Template	82
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_080

Type	Read
Score	79
Start on Template	98
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C551_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	41
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1274

Type	Read
Score	110
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C173_002

Type	Read
Score	108
Start on Template	80
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C185

Type	Read
Score	111
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C216_002

Type	Read
Score	161
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C217

Type	Read
Score	142
Start on Template	2
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C256_003

Type	Read
Score	138
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_220

Type	Read
Score	31
Start on Template	70
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_098

Type	Read
Score	29
Start on Template	151
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_101

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_180

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_322

Type	Read
Score	29
Start on Template	78
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_326

Type	Read
Score	40
Start on Template	132
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1588

Type	Read
Score	38
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_449

Type	Read
Score	35
Start on Template	168
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_189

Type	Read
Score	29
Start on Template	115
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_420

Type	Read
Score	25
Start on Template	71
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C602

Type	Read
Score	53
Start on Template	56
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_116

Type	Read
Score	32
Start on Template	180
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_119

Type	Read
Score	29
Start on Template	146
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_129

Type	Read
Score	33
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_282

Type	Read
Score	37
Start on Template	25
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_196

Type	Read
Score	31
Start on Template	125
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1335

Type	Read
Score	41
Start on Template	179
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_143

Type	Read
Score	42
Start on Template	175
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_179

Type	Read
Score	38
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1587

Type	Read
Score	39
Start on Template	65
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_324

Type	Read
Score	34
Start on Template	167
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_452

Type	Read
Score	34
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1648

Type	Read
Score	47
Start on Template	58
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C761

Type	Read
Score	48
Start on Template	18
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_519

Type	Read
Score	32
Start on Template	180
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C988_002

Type	Read
Score	48
Start on Template	15
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_297

Type	Read
Score	39
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_204

Type	Read
Score	31
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_207

Type	Read
Score	39
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_264

Type	Read
Score	48
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1983

Type	Read
Score	39
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_891

Type	Read
Score	42
Start on Template	165
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_356

Type	Read
Score	29
Start on Template	151
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_320

Type	Read
Score	34
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_225

Type	Read
Score	36
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_362

Type	Read
Score	44
Start on Template	114
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C431

Type	Read
Score	43
Start on Template	29
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_230

Type	Read
Score	32
Start on Template	179
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2251

Type	Read
Score	45
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_374

Type	Read
Score	31
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1944

Type	Read
Score	34
Start on Template	25
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2129

Type	Read
Score	39
Start on Template	49
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_477

Type	Read
Score	39
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_587

Type	Read
Score	39
Start on Template	9
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_392

Type	Read
Score	33
Start on Template	130
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2999

Type	Read
Score	38
Start on Template	25
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_499

Type	Read
Score	43
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C62

Type	Read
Score	29
Start on Template	151
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_478

Type	Read
Score	30
Start on Template	201
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_400

Type	Read
Score	47
Start on Template	176
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1533_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	202
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1915

Type	Read
Score	47
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1983_003

Type	Read
Score	46
Start on Template	50
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C268_002

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C288_002

Type	Read
Score	43
Start on Template	106
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C290_002

Type	Read
Score	31
Start on Template	17
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C329

Type	Read
Score	34
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_390

Type	Read
Score	38
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C682_002

Type	Read
Score	52
Start on Template	57
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_666

Type	Read
Score	55
Start on Template	71
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1168

Type	Read
Score	39
Start on Template	63
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3360

Type	Read
Score	36
Start on Template	73
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2007_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	175
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_693

Type	Read
Score	44
Start on Template	181
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_415

Type	Read
Score	72
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_417

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C195_002

Type	Read
Score	94
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C201_003

Type	Read
Score	162
Start on Template	154
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_386

Type	Read
Score	45
Start on Template	93
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1806

Type	Read
Score	43
Start on Template	65
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_388

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_389

Type	Read
Score	53
Start on Template	92
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C544_003

Type	Read
Score	47
Start on Template	38
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_395

Type	Read
Score	79
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_422

Type	Read
Score	40
Start on Template	95
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1885_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	26
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C87_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_447

Type	Read
Score	35
Start on Template	68
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C191_002

Type	Read
Score	34
Start on Template	55
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C290_004

Type	Read
Score	100
Start on Template	9
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C744_003

Type	Read
Score	35
Start on Template	155
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C981_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_497

Type	Read
Score	37
Start on Template	156
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1850_003

Type	Read
Score	34
Start on Template	155
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1893_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	195
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C49_002

Type	Read
Score	59
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C465_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	17
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C505_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	63
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_717

Type	Read
Score	36
Start on Template	179
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1720

Type	Read
Score	95
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C154_005

Type	Read
Score	121
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C164_004

Type	Read
Score	182
Start on Template	154
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C177_003

Type	Read
Score	37
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C217_004

Type	Read
Score	45
Start on Template	93
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2571

Type	Read
Score	39
Start on Template	69
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C423_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	132
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C615

Type	Read
Score	56
Start on Template	141
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1632

Type	Read
Score	43
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1723_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	175
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C56_002

Type	Read
Score	59
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1850

Type	Read
Score	77
Start on Template	207
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_503

Type	Read
Score	55
Start on Template	207
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C114_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	69
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C163_003

Type	Read
Score	93
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C170_004

Type	Read
Score	145
Start on Template	156
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C268_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	70
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_510

Type	Read
Score	50
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C419_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	196
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1783

Type	Read
Score	43
Start on Template	171
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1522_002

Type	Read
Score	29
Start on Template	185
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C199_005

Type	Read
Score	117
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C562_002

Type	Read
Score	49
Start on Template	57
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1137_003

Type	Read
Score	43
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_536

Type	Read
Score	31
Start on Template	209
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C33_003

Type	Read
Score	36
Start on Template	204
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_541

Type	Read
Score	36
Start on Template	137
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1874

Type	Read
Score	35
Start on Template	208
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C163_005

Type	Read
Score	47
Start on Template	204
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C528_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	189
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C634_004

Type	Read
Score	50
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_596

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C968_006

Type	Read
Score	46
Start on Template	25
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2262

Type	Read
Score	43
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1630

Type	Read
Score	40
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1837_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	53
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_635

Type	Read
Score	39
Start on Template	104
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C543_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	154
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C557_003

Type	Read
Score	36
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_637

Type	Read
Score	35
Start on Template	183
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C888_003

Type	Read
Score	40
Start on Template	132
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1012_003

Type	Read
Score	53
Start on Template	156
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1118_002

Type	Read
Score	28
Start on Template	76
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_914

Type	Read
Score	44
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1288

Type	Read
Score	51
Start on Template	18
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1430_005

Type	Read
Score	42
Start on Template	135
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_730

Type	Read
Score	39
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2697

Type	Read
Score	45
Start on Template	21
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C265_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	160
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2303

Type	Read
Score	45
Start on Template	161
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C931_003

Type	Read
Score	40
Start on Template	18
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1110_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	132
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3861

Type	Read
Score	44
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_918

Type	Read
Score	43
Start on Template	19
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1318_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1741_004

Type	Read
Score	27
Start on Template	210
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_802

Type	Read
Score	46
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2053_002

Type	Read
Score	61
Start on Template	18
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2633

Type	Read
Score	50
Start on Template	49
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C353_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_780

Type	Read
Score	48
Start on Template	174
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2780

Type	Read
Score	39
Start on Template	3
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2247

Type	Read
Score	67
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1409_002

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_986

Type	Read
Score	57
Start on Template	70
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1458_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	132
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1481_004

Type	Read
Score	53
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_927

Type	Read
Score	42
Start on Template	178
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2286

Type	Read
Score	39
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2847

Type	Read
Score	45
Start on Template	201
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C175_008

Type	Read
Score	44
Start on Template	168
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_840

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C352_002

Type	Read
Score	34
Start on Template	61
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_848

Type	Read
Score	35
Start on Template	183
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_976

Type	Read
Score	34
Start on Template	6
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1166

Type	Read
Score	39
Start on Template	156
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1281_002

Type	Read
Score	64
Start on Template	51
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_863

Type	Read
Score	43
Start on Template	19
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2584

Type	Read
Score	53
Start on Template	11
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_984

Type	Read
Score	67
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1617_003

Type	Read
Score	41
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2107_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	175
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_999

Type	Read
Score	37
Start on Template	11
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_941

Type	Read
Score	47
Start on Template	177
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2588_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	198
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C2865_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	18
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2868

Type	Read
Score	43
Start on Template	107
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C55_006

Type	Read
Score	31
Start on Template	58
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C81_010

Type	Read
Score	33
Start on Template	58
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3446

Type	Read
Score	45
Start on Template	25
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_963

Type	Read
Score	104
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_893

Type	Read
Score	96
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_894

Type	Read
Score	96
Start on Template	68
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_895

Type	Read
Score	120
Start on Template	198
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C324_003

Type	Read
Score	29
Start on Template	182
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_967

Type	Read
Score	88
Start on Template	102
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1023

Type	Read
Score	64
Start on Template	60
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3805

Type	Read
Score	95
Start on Template	67
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_899

Type	Read
Score	108
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_853

Type	Read
Score	68
Start on Template	121
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1269

Type	Read
Score	97
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C657_005

Type	Read
Score	99
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3488

Type	Read
Score	33
Start on Template	0
Length on Template	7
Start on Read	2
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C740_006

Type	Read
Score	46
Start on Template	95
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C836_005

Type	Read
Score	43
Start on Template	50
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C863_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	47
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3752

Type	Read
Score	43
Start on Template	57
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1017_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	58
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1236_002

Type	Read
Score	138
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1484_002

Type	Read
Score	63
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1546_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	132
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1649_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_933

Type	Read
Score	80
Start on Template	132
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1930_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	163
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1813

Type	Read
Score	41
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1005

Type	Read
Score	128
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C134_005

Type	Read
Score	63
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_962

Type	Read
Score	62
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C234_006

Type	Read
Score	35
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3695

Type	Read
Score	190
Start on Template	154
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

Combined_970

Type	Read
Score	104
Start on Template	67
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C598_005

Type	Read
Score	97
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C647_004

Type	Read
Score	92
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3348

Type	Read
Score	45
Start on Template	206
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1801

Type	Read
Score	40
Start on Template	132
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1016_004

Type	Read
Score	50
Start on Template	60
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1159_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	132
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1233_002

Type	Read
Score	133
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1485_005

Type	Read
Score	49
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1562_002

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1571_002

Type	Read
Score	37
Start on Template	182
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1651_002

Type	Read
Score	41
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1823_002

Type	Read
Score	29
Start on Template	151
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C2121_005

Type	Read
Score	40
Start on Template	199
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2312

Type	Read
Score	47
Start on Template	53
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1014

Type	Read
Score	63
Start on Template	189
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1015

Type	Read
Score	48
Start on Template	92
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C176_004

Type	Read
Score	63
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C232_008

Type	Read
Score	68
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C283_006

Type	Read
Score	115
Start on Template	159
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3396

Type	Read
Score	78
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3471

Type	Read
Score	88
Start on Template	103
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C306_004

Type	Read
Score	62
Start on Template	104
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3804

Type	Read
Score	84
Start on Template	68
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1017

Type	Read
Score	29
Start on Template	53
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C389_002

Type	Read
Score	69
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C463_005

Type	Read
Score	112
Start on Template	194
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1025

Type	Read
Score	120
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C627_002

Type	Read
Score	106
Start on Template	156
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C651_003

Type	Read
Score	35
Start on Template	183
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C685_004

Type	Read
Score	118
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1027

Type	Read
Score	107
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1030

Type	Read
Score	69
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1033

Type	Read
Score	102
Start on Template	179
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C865

Type	Read
Score	95
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C869_005

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	3
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C932_003

Type	Read
Score	104
Start on Template	98
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C933_003

Type	Read
Score	44
Start on Template	83
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1035_002

Type	Read
Score	78
Start on Template	24
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1139

Type	Read
Score	50
Start on Template	60
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1040

Type	Read
Score	64
Start on Template	114
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2241

Type	Read
Score	39
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1324_003

Type	Read
Score	152
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3369

Type	Read
Score	63
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1336_004

Type	Read
Score	165
Start on Template	2
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1041

Type	Read
Score	44
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1421_002

Type	Read
Score	135
Start on Template	0
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1042

Type	Read
Score	137
Start on Template	0
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C1770_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	17
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_995

Type	Read
Score	144
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2270_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1144

Type	Read
Score	134
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2691_002

Type	Read
Score	104
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C2709_002

Type	Read
Score	110
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C60_010

Type	Read
Score	34
Start on Template	21
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C168_006

Type	Read
Score	50
Start on Template	24
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1719

Type	Read
Score	47
Start on Template	185
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C215_003

Type	Read
Score	77
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C271_003

Type	Read
Score	159
Start on Template	154
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C352_003

Type	Read
Score	48
Start on Template	142
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C368_005

Type	Read
Score	33
Start on Template	180
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C415_002

Type	Read
Score	68
Start on Template	11
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C421_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	142
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C479_005

Type	Read
Score	152
Start on Template	154
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C730_004

Type	Read
Score	152
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1750

Type	Read
Score	40
Start on Template	132
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1827

Type	Read
Score	34
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1032_002

Type	Read
Score	192
Start on Template	151
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	28
Positional Score
Alignment graphic

C1328_003

Type	Read
Score	183
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1342_004

Type	Read
Score	136
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1755_003

Type	Read
Score	36
Start on Template	25
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1767_005

Type	Read
Score	39
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1870_005

Type	Read
Score	52
Start on Template	95
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C2199_002

Type	Read
Score	109
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1546

Type	Read
Score	108
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2736

Type	Read
Score	65
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2754_002

Type	Read
Score	110
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C202_004

Type	Read
Score	83
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1091

Type	Read
Score	73
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1008

Type	Read
Score	105
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3523

Type	Read
Score	58
Start on Template	206
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2881

Type	Read
Score	29
Start on Template	206
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C263_007

Type	Read
Score	39
Start on Template	206
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1118

Type	Read
Score	43
Start on Template	179
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C240_004

Type	Read
Score	80
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C75_010

Type	Read
Score	33
Start on Template	9
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1113

Type	Read
Score	112
Start on Template	175
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C574_002

Type	Read
Score	48
Start on Template	41
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C675_004

Type	Read
Score	107
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C702_004

Type	Read
Score	159
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1130

Type	Read
Score	118
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1154

Type	Read
Score	57
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1134

Type	Read
Score	64
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1145

Type	Read
Score	36
Start on Template	74
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1119

Type	Read
Score	29
Start on Template	180
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1147

Type	Read
Score	109
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1137

Type	Read
Score	120
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1112

Type	Read
Score	50
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C715_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C742_004

Type	Read
Score	169
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C754_005

Type	Read
Score	132
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1098_004

Type	Read
Score	47
Start on Template	134
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C16_006

Type	Read
Score	48
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1258

Type	Read
Score	36
Start on Template	74
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C162_005

Type	Read
Score	118
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C187_005

Type	Read
Score	66
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C404_006

Type	Read
Score	45
Start on Template	154
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C703_004

Type	Read
Score	95
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1408

Type	Read
Score	98
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C98_013

Type	Read
Score	133
Start on Template	156
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C192_010

Type	Read
Score	118
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C447_005

Type	Read
Score	45
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1225

Type	Read
Score	64
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C782_003

Type	Read
Score	100
Start on Template	133
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C850_004

Type	Read
Score	56
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1146_002

Type	Read
Score	61
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1159

Type	Read
Score	105
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1230_003

Type	Read
Score	85
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C118_007

Type	Read
Score	43
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1167

Type	Read
Score	37
Start on Template	134
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1173

Type	Read
Score	30
Start on Template	136
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C820_005

Type	Read
Score	116
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1231

Type	Read
Score	123
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C854_004

Type	Read
Score	55
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C862_002

Type	Read
Score	164
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1042

Type	Read
Score	104
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1181

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1172

Type	Read
Score	48
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1277_005

Type	Read
Score	47
Start on Template	47
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1183

Type	Read
Score	63
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C80_005

Type	Read
Score	97
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C132_008

Type	Read
Score	57
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C820_006

Type	Read
Score	121
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C865_003

Type	Read
Score	43
Start on Template	48
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C889_005

Type	Read
Score	139
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C907_005

Type	Read
Score	56
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C949_002

Type	Read
Score	32
Start on Template	117
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1023_005

Type	Read
Score	107
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1287_004

Type	Read
Score	56
Start on Template	47
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1244

Type	Read
Score	64
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1345_004

Type	Read
Score	72
Start on Template	47
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C79_006

Type	Read
Score	33
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C109_012

Type	Read
Score	33
Start on Template	207
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1189

Type	Read
Score	151
Start on Template	155
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C415_004

Type	Read
Score	29
Start on Template	78
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C423_009

Type	Read
Score	29
Start on Template	107
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1256

Type	Read
Score	29
Start on Template	170
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C445_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	27
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C456_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	210
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C488_005

Type	Read
Score	78
Start on Template	196
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C490_006

Type	Read
Score	38
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C505_008

Type	Read
Score	106
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1197

Type	Read
Score	80
Start on Template	122
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C534_007

Type	Read
Score	39
Start on Template	51
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C554_006

Type	Read
Score	40
Start on Template	184
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1264

Type	Read
Score	38
Start on Template	27
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C596_003

Type	Read
Score	53
Start on Template	46
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1277

Type	Read
Score	53
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C623_006

Type	Read
Score	97
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C642_003

Type	Read
Score	106
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C659_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	136
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C679_002

Type	Read
Score	90
Start on Template	80
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1444

Type	Read
Score	53
Start on Template	184
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C713_008

Type	Read
Score	29
Start on Template	48
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C721_005

Type	Read
Score	57
Start on Template	83
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C769_005

Type	Read
Score	32
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C770_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	3
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C839_005

Type	Read
Score	50
Start on Template	166
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C860_006

Type	Read
Score	106
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C922_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	179
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C948_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	170
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1023_006

Type	Read
Score	34
Start on Template	51
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1230_004

Type	Read
Score	31
Start on Template	72
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1309

Type	Read
Score	49
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1491

Type	Read
Score	31
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1316

Type	Read
Score	46
Start on Template	69
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1316_004

Type	Read
Score	50
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1457_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	177
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1340

Type	Read
Score	34
Start on Template	1
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1505_005

Type	Read
Score	43
Start on Template	17
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1506_003

Type	Read
Score	79
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1527

Type	Read
Score	50
Start on Template	198
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1627_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	127
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1219

Type	Read
Score	121
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1357

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1516

Type	Read
Score	91
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1731_004

Type	Read
Score	42
Start on Template	0
Length on Template	12
Start on Read	4
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1367

Type	Read
Score	106
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1760_004

Type	Read
Score	35
Start on Template	207
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1381

Type	Read
Score	40
Start on Template	180
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1944_004

Type	Read
Score	41
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1387

Type	Read
Score	34
Start on Template	0
Length on Template	6
Start on Read	3
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1535

Type	Read
Score	46
Start on Template	43
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1394

Type	Read
Score	34
Start on Template	80
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2072_003

Type	Read
Score	44
Start on Template	55
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C2075_003

Type	Read
Score	56
Start on Template	1
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1541

Type	Read
Score	183
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C2204_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	117
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1552

Type	Read
Score	46
Start on Template	117
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1402

Type	Read
Score	34
Start on Template	78
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1558

Type	Read
Score	40
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2266

Type	Read
Score	42
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C2273_003

Type	Read
Score	37
Start on Template	51
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1411

Type	Read
Score	94
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2302_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	174
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2310

Type	Read
Score	46
Start on Template	1
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2365_002

Type	Read
Score	122
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C2508_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C2541_002

Type	Read
Score	95
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1565

Type	Read
Score	46
Start on Template	177
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2627_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	0
Length on Template	20
Start on Read	8
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2631_002

Type	Read
Score	88
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2688

Type	Read
Score	54
Start on Template	146
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1245

Type	Read
Score	46
Start on Template	116
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1424

Type	Read
Score	40
Start on Template	70
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2736_002

Type	Read
Score	44
Start on Template	70
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2768_003

Type	Read
Score	50
Start on Template	62
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C2796_004

Type	Read
Score	55
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C56_005

Type	Read
Score	48
Start on Template	74
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1437

Type	Read
Score	38
Start on Template	77
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1433

Type	Read
Score	160
Start on Template	155
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C172_009

Type	Read
Score	39
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1449

Type	Read
Score	109
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C176_006

Type	Read
Score	98
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C489_005

Type	Read
Score	93
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C497_005

Type	Read
Score	35
Start on Template	80
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C507_005

Type	Read
Score	84
Start on Template	83
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C508_010

Type	Read
Score	80
Start on Template	83
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C610_006

Type	Read
Score	51
Start on Template	160
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C615_006

Type	Read
Score	46
Start on Template	62
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C674_005

Type	Read
Score	64
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1476

Type	Read
Score	38
Start on Template	62
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C681_002

Type	Read
Score	109
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C721_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	51
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C788_005

Type	Read
Score	51
Start on Template	72
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C833_003

Type	Read
Score	272
Start on Template	155
Length on Template	34
Start on Read	0
Length of Read	34
Positional Score
Alignment graphic

C896_007

Type	Read
Score	41
Start on Template	69
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C902_004

Type	Read
Score	42
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1496

Type	Read
Score	40
Start on Template	162
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C988_005

Type	Read
Score	36
Start on Template	49
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1499

Type	Read
Score	46
Start on Template	177
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1513

Type	Read
Score	55
Start on Template	155
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1198_003

Type	Read
Score	119
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1229_002

Type	Read
Score	96
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1523

Type	Read
Score	38
Start on Template	77
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1332_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	179
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1354_006

Type	Read
Score	51
Start on Template	87
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1403_005

Type	Read
Score	42
Start on Template	78
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1538

Type	Read
Score	64
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1583_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	3
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1594

Type	Read
Score	161
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1542

Type	Read
Score	39
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1611_005

Type	Read
Score	142
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1548

Type	Read
Score	29
Start on Template	77
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1680_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	18
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1550

Type	Read
Score	42
Start on Template	67
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1734_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	119
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1764_003

Type	Read
Score	38
Start on Template	144
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1543

Type	Read
Score	107
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1963_008

Type	Read
Score	37
Start on Template	49
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C2000

Type	Read
Score	39
Start on Template	0
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1572

Type	Read
Score	132
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2044_006

Type	Read
Score	96
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2052_005

Type	Read
Score	101
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2056_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	61
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2100_003

Type	Read
Score	50
Start on Template	132
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1562

Type	Read
Score	44
Start on Template	16
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1428

Type	Read
Score	119
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2208_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	28
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1584

Type	Read
Score	100
Start on Template	133
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C49_007

Type	Read
Score	42
Start on Template	61
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C119_010

Type	Read
Score	135
Start on Template	155
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2877

Type	Read
Score	124
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C188_005

Type	Read
Score	98
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C240_007

Type	Read
Score	118
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C261_016

Type	Read
Score	56
Start on Template	86
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C279_010

Type	Read
Score	83
Start on Template	83
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C338_005

Type	Read
Score	53
Start on Template	136
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C347_010

Type	Read
Score	96
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C359_010

Type	Read
Score	60
Start on Template	98
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C420_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	106
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C506_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C538_007

Type	Read
Score	45
Start on Template	167
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C595_005

Type	Read
Score	38
Start on Template	204
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C598_007

Type	Read
Score	34
Start on Template	180
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1534

Type	Read
Score	42
Start on Template	122
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C842_003

Type	Read
Score	29
Start on Template	78
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C880_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C969_004

Type	Read
Score	77
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1050_005

Type	Read
Score	48
Start on Template	54
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1168_003

Type	Read
Score	39
Start on Template	46
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1518

Type	Read
Score	143
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1374_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	42
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1553_006

Type	Read
Score	60
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1629_007

Type	Read
Score	94
Start on Template	175
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1707_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	3
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1835_008

Type	Read
Score	125
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1868_005

Type	Read
Score	47
Start on Template	48
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1869_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	135
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1571

Type	Read
Score	114
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2021_004

Type	Read
Score	123
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2031_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	114
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C2058_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	70
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2080_003

Type	Read
Score	79
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2097_005

Type	Read
Score	67
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2116_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	40
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2119_003

Type	Read
Score	39
Start on Template	0
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C2140_006

Type	Read
Score	35
Start on Template	48
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2163_004

Type	Read
Score	101
Start on Template	134
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C295_010

Type	Read
Score	45
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1692

Type	Read
Score	43
Start on Template	73
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1623

Type	Read
Score	37
Start on Template	70
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C711_007

Type	Read
Score	42
Start on Template	60
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1008_005

Type	Read
Score	43
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1685

Type	Read
Score	43
Start on Template	15
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2529

Type	Read
Score	37
Start on Template	112
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C426_009

Type	Read
Score	49
Start on Template	57
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1651

Type	Read
Score	29
Start on Template	191
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C100_007

Type	Read
Score	86
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1732

Type	Read
Score	46
Start on Template	11
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1723_008

Type	Read
Score	43
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2518

Type	Read
Score	34
Start on Template	180
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C357_007

Type	Read
Score	47
Start on Template	61
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C421_009

Type	Read
Score	44
Start on Template	46
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C546_007

Type	Read
Score	48
Start on Template	173
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C684_004

Type	Read
Score	45
Start on Template	9
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1062_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C681_004

Type	Read
Score	53
Start on Template	174
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1266_007

Type	Read
Score	43
Start on Template	155
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C168_012

Type	Read
Score	60
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2520

Type	Read
Score	31
Start on Template	9
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1797

Type	Read
Score	33
Start on Template	93
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1798

Type	Read
Score	39
Start on Template	65
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C784_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	58
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1835

Type	Read
Score	76
Start on Template	140
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1758

Type	Read
Score	66
Start on Template	51
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1535_004

Type	Read
Score	34
Start on Template	149
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2222_005

Type	Read
Score	43
Start on Template	73
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C398_010

Type	Read
Score	43
Start on Template	12
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C443_009

Type	Read
Score	49
Start on Template	196
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C458_006

Type	Read
Score	50
Start on Template	53
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C546_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	57
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C843_005

Type	Read
Score	54
Start on Template	151
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C871_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	10
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1218_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1301_008

Type	Read
Score	41
Start on Template	53
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2968

Type	Read
Score	42
Start on Template	179
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C2501

Type	Read
Score	32
Start on Template	108
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2513

Type	Read
Score	38
Start on Template	46
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C477_005

Type	Read
Score	102
Start on Template	77
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C585_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	142
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2481

Type	Read
Score	52
Start on Template	58
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1116_006

Type	Read
Score	65
Start on Template	51
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C111_016

Type	Read
Score	31
Start on Template	47
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C169_009

Type	Read
Score	104
Start on Template	207
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C328_008

Type	Read
Score	43
Start on Template	59
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C637_008

Type	Read
Score	36
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C711_010

Type	Read
Score	102
Start on Template	77
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C755_007

Type	Read
Score	84
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1589_004

Type	Read
Score	57
Start on Template	51
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1663_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	173
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C133_012

Type	Read
Score	86
Start on Template	185
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C798_009

Type	Read
Score	37
Start on Template	205
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1039_005

Type	Read
Score	72
Start on Template	162
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	30
Positional Score
Alignment graphic

C1321_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1423_005

Type	Read
Score	66
Start on Template	51
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C293_008

Type	Read
Score	45
Start on Template	57
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C445_004

Type	Read
Score	53
Start on Template	92
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1272_005

Type	Read
Score	42
Start on Template	204
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1298_005

Type	Read
Score	66
Start on Template	51
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2083

Type	Read
Score	35
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C104_013

Type	Read
Score	44
Start on Template	176
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1898

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1899

Type	Read
Score	43
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1939

Type	Read
Score	32
Start on Template	53
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2077

Type	Read
Score	34
Start on Template	28
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C841_009

Type	Read
Score	35
Start on Template	45
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1004_009

Type	Read
Score	39
Start on Template	31
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1988

Type	Read
Score	35
Start on Template	137
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1951

Type	Read
Score	34
Start on Template	137
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1955

Type	Read
Score	39
Start on Template	45
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C75_012

Type	Read
Score	34
Start on Template	179
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2051

Type	Read
Score	34
Start on Template	126
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2121

Type	Read
Score	34
Start on Template	28
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1296_004

Type	Read
Score	40
Start on Template	45
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2004

Type	Read
Score	34
Start on Template	66
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3599

Type	Read
Score	39
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1082_006

Type	Read
Score	30
Start on Template	49
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1626_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	172
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C160_010

Type	Read
Score	31
Start on Template	3
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2100

Type	Read
Score	28
Start on Template	80
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2113

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C775_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	28
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2052

Type	Read
Score	120
Start on Template	175
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2058

Type	Read
Score	37
Start on Template	109
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C664_006

Type	Read
Score	53
Start on Template	160
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	28
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3205

Type	Read
Score	44
Start on Template	46
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2124

Type	Read
Score	41
Start on Template	172
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3148

Type	Read
Score	35
Start on Template	176
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1566_008

Type	Read
Score	41
Start on Template	172
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C769_011

Type	Read
Score	51
Start on Template	75
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C71_014

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C985_005

Type	Read
Score	34
Start on Template	137
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C320_004

Type	Read
Score	34
Start on Template	23
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2161

Type	Read
Score	76
Start on Template	75
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1173_002

Type	Read
Score	50
Start on Template	65
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3624

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1088_004

Type	Read
Score	144
Start on Template	172
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1602_005

Type	Read
Score	84
Start on Template	5
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C111_019

Type	Read
Score	34
Start on Template	60
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1095_010

Type	Read
Score	56
Start on Template	75
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1630_004

Type	Read
Score	93
Start on Template	5
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C2056_007

Type	Read
Score	75
Start on Template	35
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2287

Type	Read
Score	35
Start on Template	182
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2399

Type	Read
Score	29
Start on Template	57
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3344

Type	Read
Score	54
Start on Template	60
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2651

Type	Read
Score	36
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2323

Type	Read
Score	37
Start on Template	77
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2330

Type	Read
Score	35
Start on Template	114
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2825

Type	Read
Score	39
Start on Template	204
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2490

Type	Read
Score	53
Start on Template	128
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2348

Type	Read
Score	55
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2711

Type	Read
Score	53
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2356

Type	Read
Score	33
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2096_007

Type	Read
Score	44
Start on Template	175
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C2197_005

Type	Read
Score	52
Start on Template	131
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2366

Type	Read
Score	52
Start on Template	56
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C2437_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2462

Type	Read
Score	32
Start on Template	130
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2810

Type	Read
Score	38
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C199_015

Type	Read
Score	39
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C351_011

Type	Read
Score	42
Start on Template	127
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C444_007

Type	Read
Score	40
Start on Template	112
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2476

Type	Read
Score	44
Start on Template	206
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2611

Type	Read
Score	29
Start on Template	180
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2652

Type	Read
Score	48
Start on Template	1
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2407

Type	Read
Score	30
Start on Template	109
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C909_009

Type	Read
Score	55
Start on Template	164
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2578

Type	Read
Score	53
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3683

Type	Read
Score	44
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1141_009

Type	Read
Score	52
Start on Template	154
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C1218_004

Type	Read
Score	52
Start on Template	172
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3653

Type	Read
Score	38
Start on Template	3
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1491_009

Type	Read
Score	59
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1538_011

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2432

Type	Read
Score	48
Start on Template	178
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2429

Type	Read
Score	63
Start on Template	172
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2436

Type	Read
Score	38
Start on Template	158
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2437

Type	Read
Score	53
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2752

Type	Read
Score	40
Start on Template	178
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2466

Type	Read
Score	38
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2468

Type	Read
Score	35
Start on Template	68
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2697

Type	Read
Score	37
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C415_012

Type	Read
Score	40
Start on Template	196
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2857

Type	Read
Score	37
Start on Template	209
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2477

Type	Read
Score	35
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2707

Type	Read
Score	36
Start on Template	7
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1112_006

Type	Read
Score	44
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1228_005

Type	Read
Score	58
Start on Template	172
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3654

Type	Read
Score	37
Start on Template	73
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2492

Type	Read
Score	37
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2830

Type	Read
Score	29
Start on Template	12
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2745

Type	Read
Score	52
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3672

Type	Read
Score	46
Start on Template	173
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2703_002

Type	Read
Score	47
Start on Template	56
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2524

Type	Read
Score	56
Start on Template	141
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2812

Type	Read
Score	29
Start on Template	211
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2574

Type	Read
Score	33
Start on Template	180
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C763_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	204
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C772_005

Type	Read
Score	48
Start on Template	56
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2531

Type	Read
Score	48
Start on Template	1
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2541

Type	Read
Score	44
Start on Template	60
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1586_007

Type	Read
Score	40
Start on Template	103
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1787_009

Type	Read
Score	52
Start on Template	172
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3657

Type	Read
Score	39
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C117_013

Type	Read
Score	33
Start on Template	130
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3681

Type	Read
Score	33
Start on Template	104
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3323

Type	Read
Score	37
Start on Template	60
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2696

Type	Read
Score	51
Start on Template	141
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2731

Type	Read
Score	41
Start on Template	127
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2771

Type	Read
Score	29
Start on Template	183
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C737_007

Type	Read
Score	42
Start on Template	50
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C882_010

Type	Read
Score	53
Start on Template	162
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

C1309_008

Type	Read
Score	41
Start on Template	133
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1398_005

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3717

Type	Read
Score	36
Start on Template	182
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2709

Type	Read
Score	46
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1333_005

Type	Read
Score	38
Start on Template	132
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1605_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	73
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2712

Type	Read
Score	43
Start on Template	70
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2808_004

Type	Read
Score	38
Start on Template	9
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C77_014

Type	Read
Score	34
Start on Template	1
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C297_010

Type	Read
Score	34
Start on Template	205
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C300_008

Type	Read
Score	181
Start on Template	154
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C520_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	154
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2650

Type	Read
Score	42
Start on Template	182
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C744_010

Type	Read
Score	48
Start on Template	56
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C753_006

Type	Read
Score	48
Start on Template	1
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C820_012

Type	Read
Score	52
Start on Template	163
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	27
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2784

Type	Read
Score	55
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1375_012

Type	Read
Score	54
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1421_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	17
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1538_013

Type	Read
Score	44
Start on Template	129
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1647_004

Type	Read
Score	45
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2713

Type	Read
Score	55
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2690

Type	Read
Score	38
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2769

Type	Read
Score	35
Start on Template	134
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C510_006

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C771_010

Type	Read
Score	49
Start on Template	55
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Positional Score
Alignment graphic

C1111_011

Type	Read
Score	48
Start on Template	5
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C1175_010

Type	Read
Score	49
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1977_005

Type	Read
Score	47
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C2533_003

Type	Read
Score	60
Start on Template	45
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	28
Positional Score
Alignment graphic

C167_016

Type	Read
Score	35
Start on Template	158
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C184_015

Type	Read
Score	62
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1753_010

Type	Read
Score	54
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1881_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2055_006

Type	Read
Score	52
Start on Template	173
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C209_011

Type	Read
Score	44
Start on Template	24
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C638_011

Type	Read
Score	46
Start on Template	83
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C720_009

Type	Read
Score	48
Start on Template	55
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C1116_008

Type	Read
Score	48
Start on Template	177
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1172_006

Type	Read
Score	55
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1345_011

Type	Read
Score	50
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1443_012

Type	Read
Score	55
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1619_009

Type	Read
Score	53
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3373

Type	Read
Score	30
Start on Template	179
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C192_022

Type	Read
Score	77
Start on Template	60
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C922_014

Type	Read
Score	40
Start on Template	135
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1151_014

Type	Read
Score	50
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1467_007

Type	Read
Score	43
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1676_011

Type	Read
Score	44
Start on Template	71
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1859_009

Type	Read
Score	55
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C262_011

Type	Read
Score	63
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C483_015

Type	Read
Score	37
Start on Template	153
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C541_009

Type	Read
Score	89
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C745_008

Type	Read
Score	51
Start on Template	46
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C799_007

Type	Read
Score	35
Start on Template	114
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C984_009

Type	Read
Score	44
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1426_005

Type	Read
Score	63
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C39_015

Type	Read
Score	28
Start on Template	1
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C99_012

Type	Read
Score	36
Start on Template	201
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C90_018

Type	Read
Score	32
Start on Template	208
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3706

Type	Read
Score	67
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3489

Type	Read
Score	46
Start on Template	179
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C111_021

Type	Read
Score	43
Start on Template	206
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C904_010

Type	Read
Score	46
Start on Template	179
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2876

Type	Read
Score	66
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C904_011

Type	Read
Score	55
Start on Template	179
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C432_017

Type	Read
Score	53
Start on Template	95
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3499

Type	Read
Score	78
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2884

Type	Read
Score	69
Start on Template	49
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C549_018

Type	Read
Score	79
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C134_019

Type	Read
Score	110
Start on Template	197
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3521

Type	Read
Score	78
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C54_015

Type	Read
Score	29
Start on Template	151
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C802_010

Type	Read
Score	32
Start on Template	0
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C962_011

Type	Read
Score	38
Start on Template	176
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1855_013

Type	Read
Score	45
Start on Template	70
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1900_014

Type	Read
Score	39
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C332_009

Type	Read
Score	45
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2967

Type	Read
Score	35
Start on Template	68
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1469_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1041_014

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1144_014

Type	Read
Score	45
Start on Template	174
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1606_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	181
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1835_011

Type	Read
Score	45
Start on Template	200
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C743_010

Type	Read
Score	47
Start on Template	116
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1532_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1567_011

Type	Read
Score	38
Start on Template	45
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1

Type	Read
Score	36
Start on Template	182
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C732_010

Type	Read
Score	54
Start on Template	19
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1385_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1628_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C708_014

Type	Read
Score	57
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1932_011

Type	Read
Score	36
Start on Template	133
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C843_015

Type	Read
Score	42
Start on Template	177
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3048

Type	Read
Score	31
Start on Template	0
Length on Template	5
Start on Read	2
Length of Read	5
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3550

Type	Read
Score	43
Start on Template	179
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1776_007

Type	Read
Score	32
Start on Template	149
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C115_012

Type	Read
Score	62
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C178_022

Type	Read
Score	44
Start on Template	42
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C800_017

Type	Read
Score	42
Start on Template	3
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3163

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C732_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	60
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3080

Type	Read
Score	42
Start on Template	182
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3098

Type	Read
Score	31
Start on Template	137
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1526_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	135
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C48_013

Type	Read
Score	39
Start on Template	209
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3073

Type	Read
Score	35
Start on Template	11
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3233

Type	Read
Score	41
Start on Template	135
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3166

Type	Read
Score	36
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C397_007

Type	Read
Score	32
Start on Template	66
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C407_013

Type	Read
Score	29
Start on Template	140
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3145

Type	Read
Score	29
Start on Template	204
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3160

Type	Read
Score	29
Start on Template	50
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C60_027

Type	Read
Score	32
Start on Template	155
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3593

Type	Read
Score	36
Start on Template	51
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C784_011

Type	Read
Score	38
Start on Template	28
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C171_021

Type	Read
Score	36
Start on Template	129
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1208_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	129
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C232_017

Type	Read
Score	35
Start on Template	179
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C212_013

Type	Read
Score	36
Start on Template	52
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C236_020

Type	Read
Score	38
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	1
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1210_012

Type	Read
Score	36
Start on Template	180
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C626_009

Type	Read
Score	38
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C2898_002

Type	Read
Score	36
Start on Template	114
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C3170

Type	Read
Score	31
Start on Template	33
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1042_009

Type	Read
Score	29
Start on Template	110
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1710_006

Type	Read
Score	35
Start on Template	134
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2140_010

Type	Read
Score	41
Start on Template	179
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C2361_003

Type	Read
Score	32
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3330

Type	Read
Score	35
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3298

Type	Read
Score	32
Start on Template	115
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3303

Type	Read
Score	31
Start on Template	117
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C282_019

Type	Read
Score	32
Start on Template	57
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2016_004

Type	Read
Score	31
Start on Template	157
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C3424

Type	Read
Score	32
Start on Template	35
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C697_016

Type	Read
Score	31
Start on Template	132
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1988_011

Type	Read
Score	54
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1998_009

Type	Read
Score	35
Start on Template	25
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2054_007

Type	Read
Score	31
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3334

Type	Read
Score	37
Start on Template	177
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C3433

Type	Read
Score	31
Start on Template	117
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3342

Type	Read
Score	55
Start on Template	61
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C811_010

Type	Read
Score	31
Start on Template	208
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C3227_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	177
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C3257

Type	Read
Score	35
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C263_021

Type	Read
Score	30
Start on Template	52
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3345

Type	Read
Score	32
Start on Template	112
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3365

Type	Read
Score	62
Start on Template	0
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1211_008

Type	Read
Score	37
Start on Template	26
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1916_016

Type	Read
Score	45
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2403_005

Type	Read
Score	35
Start on Template	184
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3364

Type	Read
Score	38
Start on Template	53
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3376

Type	Read
Score	47
Start on Template	53
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3383

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	3
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3385

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	1
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3408

Type	Read
Score	53
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3389

Type	Read
Score	38
Start on Template	48
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C2718_011

Type	Read
Score	31
Start on Template	205
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C3196_003

Type	Read
Score	31
Start on Template	62
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3394

Type	Read
Score	84
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C274_023

Type	Read
Score	56
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3472

Type	Read
Score	46
Start on Template	53
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C385_020

Type	Read
Score	61
Start on Template	102
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C710_011

Type	Read
Score	31
Start on Template	72
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C769_015

Type	Read
Score	39
Start on Template	3
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C772_011

Type	Read
Score	31
Start on Template	31
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3427

Type	Read
Score	54
Start on Template	114
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1586_011

Type	Read
Score	44
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3841

Type	Read
Score	68
Start on Template	132
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3412

Type	Read
Score	35
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C227_016

Type	Read
Score	83
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C442_014

Type	Read
Score	46
Start on Template	42
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1745_012

Type	Read
Score	35
Start on Template	83
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2481_004

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3444

Type	Read
Score	30
Start on Template	179
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3416

Type	Read
Score	66
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C208_025

Type	Read
Score	83
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C223_018

Type	Read
Score	73
Start on Template	102
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C236_021

Type	Read
Score	73
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C261_024

Type	Read
Score	38
Start on Template	54
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C360_015

Type	Read
Score	84
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C383_022

Type	Read
Score	76
Start on Template	102
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C440_011

Type	Read
Score	46
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C535_010

Type	Read
Score	74
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C661_015

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C734_017

Type	Read
Score	67
Start on Template	102
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3449

Type	Read
Score	86
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1000_009

Type	Read
Score	53
Start on Template	0
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1017_014

Type	Read
Score	61
Start on Template	198
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1143_012

Type	Read
Score	102
Start on Template	98
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1220_013

Type	Read
Score	84
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3453

Type	Read
Score	47
Start on Template	132
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C1350_007

Type	Read
Score	41
Start on Template	122
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1372_013

Type	Read
Score	29
Start on Template	136
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1484_008

Type	Read
Score	54
Start on Template	114
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1602_011

Type	Read
Score	107
Start on Template	42
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1697_010

Type	Read
Score	58
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	3
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1712_011

Type	Read
Score	67
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	1
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1969_009

Type	Read
Score	84
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1989_010

Type	Read
Score	39
Start on Template	174
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2292_004

Type	Read
Score	67
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C2306_007

Type	Read
Score	52
Start on Template	114
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2308_005

Type	Read
Score	31
Start on Template	162
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2404_005

Type	Read
Score	45
Start on Template	3
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2434_003

Type	Read
Score	62
Start on Template	132
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2451_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	134
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3469

Type	Read
Score	54
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C337_021

Type	Read
Score	49
Start on Template	25
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C437_019

Type	Read
Score	65
Start on Template	207
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C447_016

Type	Read
Score	65
Start on Template	207
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C458_015

Type	Read
Score	72
Start on Template	142
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C500_018

Type	Read
Score	29
Start on Template	77
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C523_011

Type	Read
Score	84
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C532_012

Type	Read
Score	70
Start on Template	104
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C538_016

Type	Read
Score	82
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C605_011

Type	Read
Score	80
Start on Template	67
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3477

Type	Read
Score	120
Start on Template	68
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C1063_014

Type	Read
Score	66
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C1372_014

Type	Read
Score	72
Start on Template	132
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1661_011

Type	Read
Score	67
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1795_012

Type	Read
Score	75
Start on Template	68
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1821_012

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C2334_009

Type	Read
Score	30
Start on Template	36
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	6
Positional Score
Alignment graphic

C2444_006

Type	Read
Score	64
Start on Template	48
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C231_020

Type	Read
Score	39
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C235_023

Type	Read
Score	72
Start on Template	102
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C248_018

Type	Read
Score	63
Start on Template	102
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C249_016

Type	Read
Score	74
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C1297_010

Type	Read
Score	65
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1957_013

Type	Read
Score	76
Start on Template	104
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C2012_011

Type	Read
Score	73
Start on Template	114
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C2535_004

Type	Read
Score	53
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C2615_007

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	4
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C643_017

Type	Read
Score	73
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C110_019

Type	Read
Score	31
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C560_027

Type	Read
Score	91
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3513

Type	Read
Score	31
Start on Template	51
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C105_019

Type	Read
Score	43
Start on Template	9
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C444_017

Type	Read
Score	78
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C163_020

Type	Read
Score	65
Start on Template	67
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C299_015

Type	Read
Score	35
Start on Template	186
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C518_020

Type	Read
Score	62
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3530

Type	Read
Score	39
Start on Template	179
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C751_011

Type	Read
Score	51
Start on Template	52
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C22_019

Type	Read
Score	48
Start on Template	187
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C61_021

Type	Read
Score	170
Start on Template	155
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C374_018

Type	Read
Score	67
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C420_014

Type	Read
Score	58
Start on Template	19
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3565

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C929_016

Type	Read
Score	36
Start on Template	137
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3590

Type	Read
Score	43
Start on Template	69
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C225_015

Type	Read
Score	35
Start on Template	204
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1072_011

Type	Read
Score	39
Start on Template	45
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3605

Type	Read
Score	32
Start on Template	181
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C747_014

Type	Read
Score	39
Start on Template	129
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C790_018

Type	Read
Score	39
Start on Template	204
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Positional Score
Alignment graphic

C868_013

Type	Read
Score	45
Start on Template	45
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C299_016

Type	Read
Score	34
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3646

Type	Read
Score	39
Start on Template	208
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1068_008

Type	Read
Score	35
Start on Template	28
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C1336_013

Type	Read
Score	37
Start on Template	134
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C238_022

Type	Read
Score	46
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C1104_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1197_016

Type	Read
Score	50
Start on Template	0
Length on Template	20
Start on Read	5
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3718

Type	Read
Score	37
Start on Template	186
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C328_024

Type	Read
Score	39
Start on Template	11
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C671_016

Type	Read
Score	40
Start on Template	60
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C773_017

Type	Read
Score	39
Start on Template	50
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

C639_019

Type	Read
Score	49
Start on Template	172
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1232_008

Type	Read
Score	31
Start on Template	41
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C661_018

Type	Read
Score	44
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C914_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	133
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Positional Score
Alignment graphic

C1409_010

Type	Read
Score	38
Start on Template	177
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Positional Score
Alignment graphic

C632_020

Type	Read
Score	53
Start on Template	154
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C731_018

Type	Read
Score	60
Start on Template	10
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	21
Positional Score
Alignment graphic

C136_024

Type	Read
Score	35
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3788

Type	Read
Score	55
Start on Template	9
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C313_023

Type	Read
Score	62
Start on Template	7
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Positional Score
Alignment graphic

C1928_011

Type	Read
Score	58
Start on Template	49
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C371_022

Type	Read
Score	54
Start on Template	158
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	20
Positional Score
Alignment graphic

C1029_008

Type	Read
Score	43
Start on Template	164
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1045_019

Type	Read
Score	42
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1385_011

Type	Read
Score	47
Start on Template	173
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3798

Type	Read
Score	91
Start on Template	48
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3799

Type	Read
Score	135
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C313_024

Type	Read
Score	97
Start on Template	196
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C336_026

Type	Read
Score	91
Start on Template	9
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C788_020

Type	Read
Score	51
Start on Template	173
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C201_029

Type	Read
Score	35
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C437_025

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C587_015

Type	Read
Score	77
Start on Template	83
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C666_015

Type	Read
Score	58
Start on Template	51
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3835

Type	Read
Score	37
Start on Template	0
Length on Template	7
Start on Read	1
Length of Read	7
Positional Score
Alignment graphic

C1541_017

Type	Read
Score	111
Start on Template	132
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C270_027

Type	Read
Score	38
Start on Template	130
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Positional Score
Alignment graphic

C402_021

Type	Read
Score	87
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

C607_021

Type	Read
Score	94
Start on Template	98
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C862_011

Type	Read
Score	140
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	23
Positional Score
Alignment graphic

C911_016

Type	Read
Score	154
Start on Template	0
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	26
Positional Score
Alignment graphic

C1318_014

Type	Read
Score	50
Start on Template	95
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	25
Positional Score
Alignment graphic

C1499_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Positional Score
Alignment graphic

C1944_009

Type	Read
Score	42
Start on Template	158
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C176_019

Type	Read
Score	44
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Positional Score
Alignment graphic

C406_025

Type	Read
Score	45
Start on Template	58
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C599_020

Type	Read
Score	80
Start on Template	98
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C627_016

Type	Read
Score	48
Start on Template	204
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Positional Score
Alignment graphic

C1277_011

Type	Read
Score	52
Start on Template	176
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	17
Positional Score
Alignment graphic

C1367_016

Type	Read
Score	49
Start on Template	62
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Positional Score
Alignment graphic

C1496_019

Type	Read
Score	67
Start on Template	48
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Positional Score
Alignment graphic

C1510_010

Type	Read
Score	135
Start on Template	114
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Positional Score
Alignment graphic

>REC-0-5_002 template
DIVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHENWSNYLAWYLQVKPSQSPQLLIYLGSSRASGVPDRFSGSGSDKDQKLKISRVETEDVGTYYCMQGRESPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREALVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTLTLNNDLTLLKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSGLRMEC
>C833_003 score:272 alignment:34M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY.SL.SS..T.L.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1281_002 score:64 alignment:13M4D1M1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.K..D.AM..LSSGA.S....GV........S....SGGCGAGFKLHC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C666_015 score:58 alignment:13M4D13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.K..E.GM..LCAGA.S....GV........S....SCGCDKLPSDKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C843_005 score:54 alignment:8M1I13M4D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSWKLKDAMLCAGASQSSCMG.G.....SDG.PL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C664_006 score:53 alignment:8M1D20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSGNLRPS.TH.TSGY.DSLH.TA.AH..G.G.DLTA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C745_008 score:51 alignment:1I6M2D13M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.TF.QD......YL..GAVVV.A....GEMD.Q.........GSKSDT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1039_005 score:72 alignment:1I12M1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGEEEEVVTC.EVVVA.GEFD.QG.SS..T.D.KLQK..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1173_002 score:50 alignment:13M11D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.PA...T....GSGSRYDDT............GTAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C863_004 score:51 alignment:2I5M2D13M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NHQ.NV.QD......YL..GAVVV.A....GEMD.Q.........GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1032_002 score:192 alignment:28M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQWKVDNA.LQGDDGQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1602_005 score:84 alignment:13M3D8M1I3M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PDPM.....S..LPTYH..ELHLHG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1630_004 score:93 alignment:10M2D12M1I3M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.P..SAAD..L..SPEYH..TLHLHG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1141_009 score:52 alignment:15M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDAM.LCAGASGVSS.E.EDDK.VLDA.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2075_003 score:56 alignment:8M4D14M unique:False
~~LTLDY.LA.H....T.PGVAADL..S..HLETK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C871_004 score:51 alignment:2I12M7D7M unique:False
~~~~~~~~~~~PLLSNT.DPGQASL..P............LLSGGTN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C911_016 score:154 alignment:26M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PDSSASS..S..MESS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C731_018 score:60 alignment:2I12M7D7M unique:False
~~~~~~~~~~~RPLSNT.DPEQASL..P............LLSGGTN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C632_020 score:53 alignment:19M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDMA.LCAGASGVSSPD.DD.K.LCQS.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C602 score:53 alignment:1I25M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGMTTS.D....VVVA.GF...E....NEGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C300_008 score:181 alignment:3M1S[2,2]20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDGQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.NSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C479_005 score:152 alignment:3M1S[2,2]4M1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDGQ.LQSGGGSQDGQTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C164_004 score:182 alignment:25M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVGNQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C371_022 score:54 alignment:10M5D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.GASGVSSPS......SS.HSSS.SQ.SS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1042 score:137 alignment:25M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PADSASL..G..GGF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1421_002 score:135 alignment:12M1D12M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLW.T.PGESASL..S..YEM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1928_011 score:58 alignment:2I6M1S[2,2]4M1D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PGP.QW.T..L.VG..LVSWP......GVPG.VF...S....TPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_012 score:52 alignment:1I11M1S[1,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDEEEETTS.DVVVA.GEMD.QG.SS..T.D.KLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C201_003 score:162 alignment:9M1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KAAEQ.LQSGGGSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3695 score:190 alignment:3M1S[2,2]20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDGQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2633 score:50 alignment:1I6M1S[2,2]4M1D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PP.WW.T..L.VG..LVSWP......GVPG.VF...S....TPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1328_003 score:183 alignment:24M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C909_009 score:55 alignment:1I10M1S[1,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSGPDVTE.EVVVA.DAME.NG.SS..S.E.KLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1342_004 score:136 alignment:12M1D11M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLW.T.PADSASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C742_004 score:169 alignment:24M unique:False
~DLVLSQ.TP.LSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C862_002 score:164 alignment:17M1S[2,2]5M unique:False
~DLVLTQ.SP.AQLSVT.PGEGTSL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C882_010 score:53 alignment:1I9M1S[1,2]2M1S[1,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGNVHCGVME.GAVVVA.GEFD.QG.SS..K.D.T~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C684_004 score:45 alignment:14M5D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~TNSQL.PPRQASL..P..P.......L.LSTN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1594 score:161 alignment:5M1S[2,2]10M1S[2,2]5M unique:False
~DLVLTS.QP.LSLSVT.PGEGTSL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1835_008 score:125 alignment:5M1S[2,2]2M1S[2,2]13M unique:False
~DLVLTS.QP.LTVSVT.PADSASL..S..MN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1869_006 score:41 alignment:4M9D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.VV...............E..ALVLDQVEAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C256_003 score:138 alignment:24M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PADSASL..N..GF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C702_004 score:159 alignment:5M1S[2,2]14M1S[2,2]1M unique:False
~DLVLTS.QP.LSLSVT.PGESASL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C216_002 score:161 alignment:5M1S[2,2]1M1S[2,2]14M unique:False
~DFVLT.NTP.SHLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1707_004 score:54 alignment:5M2D17M unique:False
~~~~LTA.DY...LLHT.PGVAADL..S..HLETK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1583_004 score:54 alignment:5M2D17M unique:False
~~~~LTL.YD...LAHT.PGVAADL..S..HLETK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1367_016 score:49 alignment:20M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVLT.LV...S....GEGSSTCSTSTPGVRSF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1324_003 score:152 alignment:8M1S[2,2]14M unique:False
~DFVLGE.EP.SHLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1233_002 score:133 alignment:24M unique:False
~DFVLDV.DG.HKVSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1541 score:183 alignment:24M unique:False
~DLVLTQ.SP.LSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1611_005 score:142 alignment:24M unique:False
~DLVLVE.SP.TLLGHT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C61_021 score:170 alignment:2M1S[2,2]1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDGQKLQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1236_002 score:138 alignment:24M unique:False
~DFVLEA.DG.HKLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C889_005 score:139 alignment:5M1S[2,2]2M1S[2,2]6M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~DLVLTS.QP.LTVSVT.PGEGTSL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C862_011 score:140 alignment:7M1D16M unique:False
~DFVLDQ.Q..HQLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C988_002 score:48 alignment:4M1S[2,2]17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVSETV..S..ETPSA..SD.DFAAGTTKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C839_005 score:50 alignment:5M1S[2,2]2M9D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ETVSE.ENSV...............L.CLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C788_005 score:51 alignment:2I23M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VLEDPTGELVLSTAGTE.ASGTGNMK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C261_016 score:56 alignment:4M11D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.SVG............M.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C170_004 score:145 alignment:2I1M1S[2,2]20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDGQ.LQSGNSQDGQTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3453 score:47 alignment:11M5D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVT.G..T..M......E..VTHQGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C426_009 score:49 alignment:22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDV.V....VAAD.MD...Q....GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C546_008 score:49 alignment:22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDV.V....VAGE.FD...Q....GSTSDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1354_006 score:51 alignment:6I11M6D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AAALGLDLGTTYSM.QGV.......FQGH..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C711_007 score:42 alignment:1I13M6D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AA.T....GQPD.RV...Q....ASLP......LLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1012_003 score:53 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HDDD.TSSDVVVAGEFD.QGSK.DST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1336_004 score:165 alignment:2I22M unique:False
~MEVLTN.SP.HSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C528_003 score:49 alignment:3M1S[2,3]17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHCGVTDCVVG.L.S.V..MDQGSS.SE.K~~~~~~~~~
>C544 score:56 alignment:1I9M4D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVPYQV.SP.........YQ..VSSLN.S....G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C562_002 score:49 alignment:22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDV.V....VAAD.FD...Q....GSSTDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2312 score:47 alignment:6M1D15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.VD..GEE.A.V....PNTD.RE...M....VSLQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C627_002 score:106 alignment:1I6M1D12M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDNA.LQN.NSQESVTE.QNSHVEET~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2533_003 score:60 alignment:2I17M4I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSPQQ.SL.VG.L..V.SW..GSSTC.STSTPGVYA.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1111_011 score:48 alignment:1I1S[2,2]20M unique:False
~~~~~ATNT.SSRPVT.PGNLPLL..S..NTCGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C217 score:142 alignment:2I22M unique:False
~FDVLGE.SP.HSLDAT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C771_010 score:49 alignment:22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..GTSSD.V....VVAG.EM...D....GAGSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C682_002 score:52 alignment:2I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTTSDV.V....VAAD.FD...Q....GSTSDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C271_003 score:159 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDNA.LQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1648 score:47 alignment:11M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.V....VVAD.AF...DQ...GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1476 score:38 alignment:4M6D2M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVVD..............SD.DLPLNVSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2768_003 score:50 alignment:4I21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGYLTYFD.LF...E....GVFEGLDFYTSLTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1017_005 score:46 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDV.V....VAGE.FD...Q....GSGMDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C784_006 score:47 alignment:11M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.V....VVAD.AF...DQ...GSSTDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C671_016 score:40 alignment:13M5D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.L....NTPV.RA...S....LQGS.....LPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C489 score:48 alignment:1I9M4D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVPYQV.SP.........YQ..VSSLN.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C290_004 score:100 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..H..GHTGP..GE.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1870_005 score:52 alignment:5I17M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVWPGQGLQMGW.LSHEGD..K..KV.L..RDL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2072_003 score:44 alignment:11M2D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..GGSLA.D....SYLD......E....GFLLDKK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C404_006 score:45 alignment:5M1D4M2D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KQELF..QEGN..ELVDL.QMEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C444_007 score:40 alignment:6M8D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTSLAA............S.FSQTV.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C574_002 score:48 alignment:1I11M2D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQ.VS.VP......YQ..VSSNG.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2481 score:52 alignment:11M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSD.V....VVAD.AF...DQ...GSTSDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2627_003 score:49 alignment:2D10M3D5M unique:False
~ .VLDQ.DC.LMLS....GETAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1189 score:151 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1433 score:160 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QDSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C415_002 score:68 alignment:9M5D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESAS.........SH..MT.PA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C119_010 score:135 alignment:7M1D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQT.NSQESVTE.QDSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2197_005 score:52 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~K.GGS.YS.NLT.L..N..NNLT.LLL..AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C187 score:48 alignment:2I9M3D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSL..GGGFS.S....GG....F...S....GRGSSF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1318_014 score:50 alignment:5I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVWPGQGLQMGW.LSHEGD..K..KV.L.RVE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C193 score:57 alignment:2I9M3D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSL..GGGFS.S....GG....F...S....GSGSFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2703_002 score:47 alignment:18M1S[1,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GPSWP.W....QVPG.SW...P....GSPWQVAD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1197_016 score:50 alignment:1D4M1S[2,3]13M unique:False
~ LTLGSAGN.EESTST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2031_005 score:46 alignment:1I20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSLLL..TFDVD..FPKE.TEQLE.AR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C421_009 score:44 alignment:1I1M1S[1,2]4M5D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSAA.RP.PL...........SSQA.S....QLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C743_010 score:47 alignment:20M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AA..SQSLG..RPPE.SLPLL.SNT.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C720_009 score:48 alignment:1S[3,3]11M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~G..VTTVD.S....VVAG.EF...DQ...GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1198_003 score:119 alignment:12M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGEASSL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3489 score:46 alignment:2I19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDL.SL..D.L.AEVK..AQYEDLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C744_010 score:48 alignment:1I13M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGVSTD.T....VVAG.EF...NQ...GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2531 score:48 alignment:19M unique:False
~~LVSWG.SS.TCSTST.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C772_005 score:48 alignment:1I13M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGVSTD.T....VVAG.EF...DQ...GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C753_006 score:48 alignment:19M unique:False
~~LVSWG.SS.TCSTST.PGVRFS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2241 score:39 alignment:6M3D7M1D2M unique:False
~~~~~~Q.TP.LSL....PLLSNTN.....CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C904_011 score:55 alignment:2I19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDL.SL..D.L.SLVK..AQYEDLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1139 score:50 alignment:1S[2,2]4M1D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT....GVMT..F...D....KDQDDKDGTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C463_005 score:112 alignment:8M2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HKVPA.S.E.NMETHQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C432_017 score:53 alignment:5I14M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVWPGQGLQMGW.LSHEGD..KK.VL.L.DR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1159_002 score:44 alignment:19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..SASN.DKA..AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1016_004 score:50 alignment:1S[2,2]7M4I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT....GEFD.AF...DAFDQGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C402_021 score:87 alignment:13M1D5M unique:False
~~~~~~Q.SG.FSLSVT.PYGH.SL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1458_004 score:44 alignment:19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..VNMD.RDD..PS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1110_002 score:44 alignment:19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..SASD.DFG..TK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C904_010 score:46 alignment:2I19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLSL.SL..D.L.VEVK..AQYDELAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2652 score:48 alignment:19M unique:False
~~LVSWG.SS.TCSTST.PGVSRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C730_004 score:152 alignment:19M unique:False
~~~~~~Q.SP.HSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1527 score:50 alignment:3M1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.EAV..TVLALG.SA.VS.NGG..AK~~
>C1229_002 score:96 alignment:14M1D4M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PMSSM.L..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2688 score:54 alignment:3I4M1S[1,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLNPDE..AVAYGAAVQAA.LLMGNK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2056_004 score:40 alignment:1I13M4D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TQ....GFLA.LF...S....GDGTE....LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1562 score:44 alignment:19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELASY..D..LPDCF..VL.LEMNGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1430_005 score:42 alignment:11M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL.VNF.C..L..NENS...E..ALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1516 score:91 alignment:10M2D7M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.P..ECYL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1219 score:121 alignment:12M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGEGTSL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2366 score:52 alignment:1I19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGSWWA.P....GSPW.PW...Q....VSLQDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1518 score:143 alignment:19M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C98_013 score:133 alignment:1I19M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDNA.LLSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C154 score:51 alignment:8M3D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGGFS.S....GG....F...S....GSGSFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1301_008 score:41 alignment:12M3D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.VN..GEEAV.S....GHH.......S....GSM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2055_006 score:52 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLLL..AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1008 score:105 alignment:14M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PVTFV..FPPS.DQELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2056_007 score:75 alignment:1I8M1S[3,3]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAWYVQKPVGR.VP.EL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1543 score:107 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PSVFL..FGVM.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2365_002 score:122 alignment:4M2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAFLMPSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2588_002 score:42 alignment:2M6D4M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C..........LS.YP.SL.QCG..L~~~
>Combined_1572 score:132 alignment:14M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DQELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1513 score:55 alignment:2I13M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLVDEA.LNEDNSVVSLSQ.PK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3799 score:135 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DEQLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1088_004 score:144 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSK.DSTY.SL.SS..T.L.TLSK..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1546_003 score:45 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..H..RPTD.MEE..M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1602_011 score:107 alignment:1S[2,2]6M1S[1,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQKPSG.RP.AGL.L..L.YL..GTSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C754_005 score:132 alignment:5M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PVSFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C800_017 score:42 alignment:2M1S[2,2]6M2D6M unique:False
~~~~LA.NTP.GRLSL...GQSLPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C168_006 score:50 alignment:6M5D1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSH..SL.L.....GGHLLSYE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1627_005 score:46 alignment:3I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLVDEALG.GED.NS.VVS.L..S..QPK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1144 score:134 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_995 score:144 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C679_002 score:90 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGLRDPY.DVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1023_005 score:107 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PVTFV..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2058_004 score:44 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFNLSDFDKELVEVATE.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C357_007 score:47 alignment:1I7M3I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TS....DVVV.AFGENE....GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C638_011 score:46 alignment:12M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTTS.DVVVAGEMDQGKQDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3672 score:46 alignment:6M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SN.DLTY..L.TL..N.N.DLTK..LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1510_010 score:135 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.NEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C154_005 score:121 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESATL..S..HHSSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C436 score:44 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSLPY.QVSN.GS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C199_005 score:117 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..S..HTHSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_003 score:93 alignment:1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~TVTVS.PGESASL..H..THSSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C544_003 score:47 alignment:2I4M1S[1,2]3M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVAGEDFQS.SC.QK.L..L.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_062 score:53 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSVPY.QVSN.GS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C173_002 score:108 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGRVEPY.DVGTYYSM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C195_002 score:94 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESAGP..L..HQESH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C551_002 score:44 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVPYQV.SP.YQ.V..S.SL..NGS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3683 score:44 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQG.L..T.PL..LSNTN.A....NTPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1218_004 score:52 alignment:1I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDTG.KEYL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C190 score:48 alignment:2M1D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~SL.VN.LGGSQSL..S..LREK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1027 score:107 alignment:2M1D14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VY..C.E.L..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_693 score:44 alignment:7M3D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS..T.S.TSS.....YSTPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C661_018 score:44 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQS.A..L.PL..LSNTN.A....NTPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1112_006 score:44 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.S..L.PL..LSNGS.Q....QTPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1228_005 score:58 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EKY.DGTL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2541 score:44 alignment:14M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.S....ASDD.YP...L....PSASD.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1787_009 score:52 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDLT.DNNL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2100_003 score:50 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.GVH.H..Q..DLHG.PYR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2429 score:63 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C685_004 score:118 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.A.C.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_2490 score:53 alignment:1I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KEQLF.QEN.GE.LVD.L..R..NDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C657_005 score:99 alignment:1I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYYN.S.M.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C1589_004 score:57 alignment:7M1D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..AT.RD.N....VTPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C553 score:45 alignment:1I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSYQV.SP.YQ.V..S.DL..NS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2012_011 score:73 alignment:2M2D5M2I4M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL....PSVFPSVFPPSVDEQL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1423_005 score:66 alignment:12M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..ASERG.K....E.PD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C313_023 score:62 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~PGE.FSLSVT.PGYSLSG..G..HY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1298_005 score:66 alignment:12M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..ASERN.V....T.PD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C681_002 score:109 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYS.A.E.E..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C1116_006 score:65 alignment:8M1D1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..ASE..TG....RRPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C508_010 score:80 alignment:11M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYH...GDYT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3509 score:100 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SRLMYY.DVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3752 score:43 alignment:1I3M1S[2,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~STSG.GT....AGPH.AA...T....GGGST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C761 score:48 alignment:9M2I2M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALL..S..SASQHQASLPLLSNTN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C176_006 score:98 alignment:2S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVC.A.E.V..THQGVS.TP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_1449 score:109 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYV.C.A.E..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C607_021 score:94 alignment:8M1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K..VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1269 score:97 alignment:6M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.D.D.YM.THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C2208_002 score:45 alignment:1I11M1D2M1S[1,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.LVSNPVDVLT.YVAGFK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2877 score:124 alignment:10M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGSL.SP.VT.K~~~~~~~~
>C336_026 score:91 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASD..S..GPHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C732_010 score:54 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..S..LNNDL..TL.LKKNSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_914 score:44 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQG.T..L.PL..LSNTN.A....NTPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C347_010 score:96 alignment:4M1I1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYG.YY.DL..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_071 score:136 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C192_010 score:118 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGSS.LP.VT.K~~~~~~~~
>C80_005 score:97 alignment:1S[2,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVM.G.D.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_2303 score:45 alignment:1I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVAGEFD.QGSK.DST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C546_007 score:48 alignment:4M1D5M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.GG.Y.SL.TLNND.L.TLLK..N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3861 score:44 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.S..L.PL..LSNTN.A....NTPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C187_005 score:66 alignment:12M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYM.G.D.V..THQSKE..P.VT.K~~~~~~~~
>C162_005 score:118 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYV.C.E.A..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C587_015 score:77 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYDD.RDPAD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1676_011 score:44 alignment:1I12M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGSKKYDSLTLNNDLTL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C599_020 score:80 alignment:7M1D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSPW.TFW.GT..K..VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C505_008 score:106 alignment:4M1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.GSE.M..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C2053_002 score:61 alignment:9M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASL..L..QMSSYP.SL.LQSSSY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1758 score:66 alignment:9M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..ASEN..S....LRPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1535 score:46 alignment:4M1S[1,2]8M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVPSGA.ST.GL.Y..E.AL...ELR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1367 score:106 alignment:6M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.S.E.NY.THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C639_019 score:49 alignment:2I2M1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGDVD.KYSL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C623_006 score:97 alignment:1S[2,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVE.D.E.M..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C240_007 score:118 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.A.E.M..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_1783 score:43 alignment:7M2D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELSK.SFT...L.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C406_025 score:45 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SDV.V....VAGE.DF...Q....GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C420_014 score:58 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T..LSLTL..TL.LKKNSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C948_004 score:51 alignment:1I8M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.QDSK.GDD...L.ST..A.L.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1147 score:109 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYG.D.M.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C642_003 score:106 alignment:3M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYAGC.C.Y..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C313_024 score:97 alignment:6M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.D.N.YM.THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C598_005 score:97 alignment:6M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.T.D.CY.THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C1035_002 score:78 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSH..SL.LHESDHSYLAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C279_010 score:83 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYMA.TGVD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2044_006 score:96 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..NNYM.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1550 score:42 alignment:2M1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F...EL...GEGENLDLPYGLER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2052_005 score:101 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVA.Q..Q..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C932_003 score:104 alignment:8M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1045_019 score:42 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..G..GDDL.HM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2691_002 score:104 alignment:2I1M1S[2,2]2M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSAS.ASSVVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C865 score:95 alignment:6I16M unique:False
~~~~~~GGGGGFSLSVT.PGESASL..S..YEM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1428 score:119 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVT.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2631_002 score:88 alignment:10M2S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VGR.F..M..GGGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1542 score:39 alignment:1I8M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HSQ.FLGY.PL.....T.L.YLEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C850_004 score:56 alignment:1M1S[2,2]11M1I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VST.L..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_005 score:116 alignment:1M1S[2,2]8M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1231 score:123 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1042 score:104 alignment:3M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.GT.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1408 score:98 alignment:1S[2,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSS.AS.LVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C703_004 score:95 alignment:11M1S[1,2]1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..DGGYF.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_006 score:121 alignment:11M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C907_005 score:56 alignment:1M1S[2,2]11M1I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVS.D..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C715_004 score:54 alignment:1I3M2D9M1I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSGT....VVC.L..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C102_003 score:89 alignment:5M1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RVTMYYDVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2709_002 score:110 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.E..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1130 score:118 alignment:1M1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2541_002 score:95 alignment:1M1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..DMLY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1565 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.EL.LS..G.L.HLEA..LYGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2754_002 score:110 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AN.AVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2736 score:65 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.Q..L..TMQR.PY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1546 score:108 alignment:11M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.E..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2199_002 score:109 alignment:8M1I3M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGT.AS.VVCHL..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C505_002 score:45 alignment:3I6M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDVVAD.AF...DQ...GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1245 score:46 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QAA..PCVLF..FDEL.DSLAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C615_006 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVPV.RD...P....ATGYTLEFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C288_002 score:43 alignment:1I1S[2,2]10M2D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSA..K..EK.L.KKKLAK....VF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C675_004 score:107 alignment:11M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..DGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C843_015 score:42 alignment:2I8M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNDL.TL.SL..T.L..LKK..NSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C681_004 score:53 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DK.DKTM.SL.TL..D.N.DLTL..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1398_005 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSN.YSLQ.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C740_006 score:46 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQLQATPL.TNAGGT..P..RD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2578 score:53 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1491_009 score:59 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TL.DN..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1538_011 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YDSL.TL.ND..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1571 score:114 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2709 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS.KYNL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2784 score:55 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.YNSL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1375_012 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSN.YSNL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_984 score:67 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1538_013 score:44 alignment:1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGLF.LEG.NE.LVD.L..R..NDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1647_004 score:45 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTS.NPNY.TL.ND..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_596 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C510_006 score:96 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..T..HEC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1175_010 score:49 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSN.YTLL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C549_002 score:49 alignment:1I7M1I2M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSPYQV.S..L.NS..G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1753_010 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TDKK.FDTV.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1172_006 score:55 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.SYNL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1409_002 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YDSL.TL.DN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2247 score:67 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSK.FSDL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1345_011 score:50 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSN.YSNL.TL.DN..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1151_014 score:50 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YNSL.TL.NN..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C193_002 score:86 alignment:1I1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGLREPY.DVGTYYSM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C984_009 score:44 alignment:2I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1426_005 score:63 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_077 score:114 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C931_003 score:40 alignment:8M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASL..P..LLSN...SG.GHSDD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_072 score:95 alignment:1I1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGLREPY.DVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C134_019 score:110 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YV.C.E.L..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>Combined_076 score:96 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1835_011 score:45 alignment:12M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.W..THVPAL.QP.VL..SG..L~~
>C1481_004 score:53 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTD.YSDL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1541_017 score:111 alignment:14M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DNFY.RP~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1159 score:105 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DLMY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1484_002 score:63 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TL.DN..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1485_005 score:49 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTY.NSDL.TL.ND..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C437_025 score:96 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..E..NHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C647_004 score:92 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..M..GCY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1562_002 score:54 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YNSL.TL.ND..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C788_020 score:51 alignment:10M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.GKYE.SL.TLNND.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C283_006 score:115 alignment:4I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LREQLQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1230_003 score:85 alignment:1S[2,2]7M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GST.AS.VVG.DDHL..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1930_005 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSQWVVDE.DDSQ.WVVS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1143_012 score:102 alignment:10M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGTG.K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2021_004 score:123 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..NDFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C419_002 score:45 alignment:4I9M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVA.G.E.K..DYEAVT.SD.VV~~~~~~~~~~
>C443_009 score:49 alignment:4I9M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVA.G.E.F..DKEAVS.TD.VD~~~~~~~~~~
>Combined_1005 score:128 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1062_006 score:47 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.SKNY.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C338_005 score:53 alignment:1I2M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS.VCV.L..G..ENQH.CDE..AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C659_002 score:44 alignment:1I2M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS.VCV.L..G..PCLH.CDE..AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C747_014 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QAS.SGS.PA.TVR.L..L..VV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1008_005 score:43 alignment:2I3M2D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK.G..Y.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1859_009 score:55 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1732 score:46 alignment:2I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~AASWR.PPEQASL..P..LLSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C860_006 score:106 alignment:10M1S[2,2]1S[1,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYMC.GAGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2119_003 score:39 alignment:15M unique:False
~DLSLEV.LP.HLYNET.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2116_002 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YQPFKPLT.VL.NL.L..L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C538_007 score:45 alignment:11M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLTE.LDEK.EYL..SL.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3477 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDFTLKLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C160_003 score:116 alignment:4I15M unique:False
~~~~~~~~VGEMSLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1900_014 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLPVL.PALQPVL..S..GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1374_004 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EVYPHV.ST.LL.N..L.CL..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1104_011 score:47 alignment:10M2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.DKNY.SL.TLNND.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_080 score:79 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSG..K..LD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1505_005 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVLL..E..AFSSP..SD.LEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1274 score:110 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C507_005 score:84 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYAE.MER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C489_005 score:93 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYTN.MGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C661_015 score:96 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~TVTVS.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2052 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SL.SS..T.L.TLSK..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2437 score:53 alignment:6M1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SN.DLTYLTL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C415_012 score:40 alignment:1I7M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVVA.G.E.F..D.QGSS.SE.K~~~~~~~~~~~
>C1321_006 score:47 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..DDEH.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C711_010 score:102 alignment:1S[3,3]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTLLSRVETE.DVGTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1210_012 score:36 alignment:1I7M4D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DL.AP..T.L.TL......YVKG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C458_006 score:50 alignment:10M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.DL..ASERG.K....E.PD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2000 score:39 alignment:15M unique:False
~DLDLSL.LP.HLYNET.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2310 score:46 alignment:11M1S[2,2]2M unique:False
~~LVLDG.NP.LTLGSL.MR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2302_003 score:42 alignment:1S[1,2]14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL.TLDL.SL.AE..R.L.YTSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2204_002 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A..VFVDL..EPSL.VEQVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1218_002 score:45 alignment:2I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTNK.YDTV.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C185 score:111 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYSM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3530 score:39 alignment:1I8M2D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTL.EE..L.L.PL....KNYEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1977_005 score:47 alignment:1I12M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TL.NN..D.LKTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C610_006 score:51 alignment:4I8M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YHTSQSGDEMTSLSE.YVSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1584 score:100 alignment:1I1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GAS.AS.VVM.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C477_005 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLKLSRLESE.DVGTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2129 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~P.AL.W..P.AL..QSPVL.S....GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1403_005 score:42 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLSQSQVELV.EVATEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C188_005 score:98 alignment:8M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGEGTSL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1767_005 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..H..SSEN.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C202_004 score:83 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DLGTYYCP.MGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C836_005 score:43 alignment:2I11M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.S..L.PL..LSSQR.G....SVM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1033 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.SS..T.L.TLSK..GEYEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1025 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_802 score:46 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YNSL.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_780 score:48 alignment:3I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGYK.PMDL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1137_003 score:43 alignment:3M1S[3,3]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VG.TVC.N..H..NDGE.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_079 score:40 alignment:5M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SLV.NLSELSL..S..LKER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C240_004 score:80 alignment:1S[2,2]7M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYCYC.VGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1029_008 score:43 alignment:1I7M1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSLSSVTVGNEQK.SNTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1137 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C268_004 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSEKLLKQKLAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1649_004 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..G..SCHN.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2584 score:53 alignment:1I3M1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~ESVTRPPEQASL..P..LLSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C116_003 score:101 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DTPW.TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1385_011 score:47 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SK.YNSL.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C189 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLVNL.SELSLSL..R..EK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2847 score:45 alignment:1I11M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RV..NVPALQ.SP.VL..SG..L~~
>C105_002 score:74 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYYAE.MER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1632 score:43 alignment:2I2M2D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLSK...SY.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C328_024 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SQT.SAPSASQ..P..SASD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_730 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET.VS.AVC.L..P..AHME.C~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C981_002 score:44 alignment:3I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLGGK.YDTV.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_899 score:108 alignment:12M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..C..SK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_895 score:120 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQGLS.SP.VT.K~~~~~~~~
>C782_003 score:100 alignment:1I1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NAS.AS.AVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1983_003 score:46 alignment:11M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..P.AL..QPSRVLS....GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2825 score:39 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQAS.LP.LL.SNG..SRM~
>Combined_1806 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AD.FD...Q....GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1113 score:112 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SL.SS..T.L.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1421_008 score:49 alignment:3I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNSYNSL..T..LNTSH..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1893_002 score:42 alignment:2I1S[1,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGGLVPA.L.Q.P..VLRGLS.S~~~~~~~~~~~~~~
>C423_004 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..G..GYDS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1499 score:46 alignment:11M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.EL.LS..G.L.HLE...AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1316 score:46 alignment:3M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVVDSEDLPLNLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2690 score:38 alignment:6M1D7M unique:False
~~~~~~~~ST.CSTS.T.PGVSRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2810 score:38 alignment:6M1D7M unique:False
~~~~~~~~ST.CSTS.T.PGVYAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C248_018 score:63 alignment:6M2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTGGK..VD.L.GKVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_085 score:42 alignment:1I7M1I2M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSPYQV.S..L.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1750 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..SASD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C737_007 score:42 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.S..L.PL..LSERY.S....PL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C734_017 score:67 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.V.GKLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C223_018 score:73 alignment:6M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KNVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2865_002 score:46 alignment:3I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQASL..P..LLSNH..SS.LKN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1168 score:39 alignment:3M1I1S[1,2]7M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDDE.AVF...L....PSASD.DF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2868 score:43 alignment:1I1M1S[1,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LT..AV..VN.W.VESLAA..AAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C763_011 score:47 alignment:2I6M1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQAGAS.LPLLS.NTG..LRM~
>C1533_002 score:42 alignment:2I6M1D3M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDDHPGLE..P.VL..SG..L~
>C1944_009 score:42 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTA.LVNGNVQHVVDA.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1587 score:39 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.FD...Q....GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2466 score:38 alignment:6M1D7M unique:False
~~~~~~~~ST.CSTS.T.PGVSFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_326 score:40 alignment:3M1S[3,3]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VG.TVC.L..P..SASN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C465_002 score:39 alignment:2M1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQTV..S..AVSQH..DD.LD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1457_005 score:37 alignment:11M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.EL.LS..A.V.HLE...AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C541_009 score:89 alignment:12M2I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGETASLHSE..C~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C109_002 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~SQWVV.CGHSHSL..P..R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C888_003 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.ANC.H..L..YNSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1266_007 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AVDRA.LVNGCVQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1144_014 score:45 alignment:3I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLDN.DLKY.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1798 score:39 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E.FD...Q....GSSTDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1835 score:76 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..L..NNFY.PTR..NLVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_362 score:44 alignment:3M1S[3,3]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTAP..SAVML..PSAS.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2121_005 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~C.G.V..PALQLG.SP.VL.S~~~~~~~
>Combined_1685 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~NGEEAVL..V..PGSWP..SM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2163_004 score:101 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1801 score:40 alignment:3M1S[3,3]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VG.TVC.L..P..SASD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C627_016 score:48 alignment:1I6M1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQAQS.LPLLS.NTG..LRM~
>C1098_004 score:47 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASS.AS.VVT.D..E..LMVY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1868_005 score:47 alignment:7M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.D...GSQVG.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1629_007 score:94 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SL.SG..M.L.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C896_007 score:41 alignment:1I5M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGVDSE.DLPLNLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C755_007 score:84 alignment:3M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSLS.PADSASL..S..C~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1272_005 score:42 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQTVS.SH.QD.KTG..FHF~
>C596_003 score:53 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQ.LH.DL.V..L.VG..GSTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_986 score:57 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSQSDKDGTLLNSQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C209_011 score:44 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQ..SL.LHGDQSGMK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C721_005 score:57 alignment:11M1S[2,3]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DGNRDYCGVCR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C968_006 score:46 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HFSC..SL.LNEDGLNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2780 score:39 alignment:1I14M unique:False
~~~LQAQ.SL.PLLSNT.CGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C133_012 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..GYEEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1955 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DGPSG.SP.AT.L..R.VL..VV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C236_021 score:73 alignment:4M1S[2,2]1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQSAN.K..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C398_010 score:43 alignment:1I1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~ASL.PLLSARE..T..CKY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C100_007 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..AYEDKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3449 score:86 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.N.KRL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C208_025 score:83 alignment:6M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KRG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1651_002 score:41 alignment:10M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..HSTDNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C447_016 score:65 alignment:8M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SP.VT.KSS..RLSCC
>C437_019 score:65 alignment:5M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SP.VTGKSF..GRNEC
>C1004_009 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QASSGSPGLDRVLVV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C615 score:56 alignment:2M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..NFNY.PTR..NLVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1496 score:40 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GNPTVEVDL.FTSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C215_003 score:77 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..AEDYKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C134_005 score:63 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSH..SL.LHGDRPMY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C535_010 score:74 alignment:7M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KN.VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C249_016 score:74 alignment:7M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..EL.VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1566_008 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLS.GPGQ.SL.LS..T.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_970 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F...S....GSGSDKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C33_003 score:36 alignment:4M1I4M3D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGTSGSP.AT......LR~~
>Combined_510 score:50 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..Y..NSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1850 score:77 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SP.VT.KSF..GRNEC
>C1626_006 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLP.GQGS.SL.LS..T.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C538_016 score:82 alignment:6M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTGGK..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C56_002 score:59 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..KADYQHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2251 score:45 alignment:10M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..PHEDDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C295_010 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..N..YDS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_005 score:47 alignment:1I8M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGES.SP.AT..SR..LN~~
>Combined_2124 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLS.PGQG.SL.LS..T.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C595_005 score:38 alignment:1S[1,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGGLE.TL.AN.ESM..MR~~
>C2270_004 score:40 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FSLL.SR.DN..L.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C169_009 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SP.VT.KSG..LRMEC
>C1050_005 score:48 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYL..GGYYV.Q....GVPG.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2097_005 score:67 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSY.SL.GA..F.L.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2513 score:38 alignment:10M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQ.QP.AL.Q..P.VL..SGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1795_012 score:75 alignment:9M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDF.LYL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1770_004 score:40 alignment:2M1S[2,2]1M2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQTV..SAVCLSSH..ED.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1534 score:42 alignment:1I4M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL..FHP...EQLL.TGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C232_008 score:68 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..SEMDKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C227_016 score:83 alignment:6M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2712 score:43 alignment:2M1D9M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SG.DKDLQPVLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1208_009 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGT.SGS.PA.TVR.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C520_009 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDMA.LCAGASGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1617_003 score:41 alignment:10M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..HGMDNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C49_002 score:59 alignment:2I4M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKTLEG....YEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1340 score:34 alignment:6M2D5M unique:False
~~LVLLD.S...SLEYK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2096_007 score:44 alignment:2I4M1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSDLTYLTL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C773_017 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.S..L.PL..LSSSH.S....Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2286 score:39 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MESL.TL.ND..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3590 score:43 alignment:2I5M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GDPSGSPAVDRVLVLG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1116_008 score:48 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNTL.SL.NN..N.L.TLLK..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1072_011 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DGPSG.SP.AT.L..V.RL..VV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1333_005 score:38 alignment:3M1D5M1S[2,3]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET..S.VVG.V..VAGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C192_022 score:77 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.S....GVPD.RF...S....SNRS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2262 score:43 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MESL.TL.ND..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C262_011 score:63 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQ..SL.LHGDNRNY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C445_003 score:38 alignment:3M1D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EL.L.SNSSDALDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1345_004 score:72 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q.SP.QL.L..L.DL..ATDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2697 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..CCHDN..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1287_004 score:56 alignment:2M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q.T..QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C865_003 score:43 alignment:7M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.D...GENKK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1837_004 score:39 alignment:6M1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LD..GEEAVA.E....THPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1277_005 score:47 alignment:2M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q.T..QL.L..L.DL..ATDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1855_013 score:45 alignment:12M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGSDPALQPVLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1277_011 score:52 alignment:2I7M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSLY.SL.TLNND.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C191_002 score:34 alignment:7M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..AVMRL.E......PD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1264 score:38 alignment:3M1D9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EL.L.SNASDALDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_020 score:65 alignment:9M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F...S....GSGSTEQTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1166 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDMA.LACGASGVSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C176_004 score:63 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSH..SL.LHGDNNRY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1424 score:40 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSGSLLNELLGLVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3805 score:95 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F...S....GSGSNKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1720 score:95 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..ADYEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_963 score:104 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESASL..S..CK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1916_016 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SNL.TL.ND..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C274_023 score:56 alignment:7M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..EL.VD.K.LRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3653 score:38 alignment:3M1I10M unique:False
~~~~LQQASL.PLLSNT.GG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C721_006 score:41 alignment:10M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.S..L.YL..GTTLKDE....GK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1411 score:94 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSY.SL.SS..T.L.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2437_002 score:39 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MESL.TL.NN..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1586_007 score:40 alignment:1I6M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VFQQGD..QELVD.L.NRFD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C172_009 score:39 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YETV.TD.PS..K.L.NGSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2736_002 score:44 alignment:1I4M1S[1,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSGSLLGGELLGLVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2292_004 score:67 alignment:6M1I4M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..LGYL..GTRS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2876 score:66 alignment:1I5M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSP.QL.L....YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3416 score:66 alignment:6M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C265_004 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSANTPGRPTT.Q~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3499 score:78 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..SSAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C585_004 score:51 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.SSR..LHVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C549_018 score:79 alignment:8M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..SGTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1983 score:39 alignment:3I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AALQPAL.QP.VR.LSG..L~~~
>C99_012 score:36 alignment:9M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~V..ATVGLT.VP.LS.R~~~~~~~
>C351_011 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DAMLK.LCQ.AS.GV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3521 score:78 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..SASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C732_011 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.T....GTND.RF...L....MAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C90 score:46 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~V..ATVGLT.VP.VT.R~~~~~~~
>Combined_2348 score:55 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1288 score:51 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASL..N..WDSYP..SL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2711 score:53 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..LNSTH..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_635 score:39 alignment:1I8M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGSGT..P..VD.D..RDL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_264 score:48 alignment:3I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AALQPAL.QP.VL.KSG..L~~~
>Combined_3657 score:39 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..T..LGSYM..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_893 score:96 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C483_015 score:37 alignment:1S[1,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MADLKLA.CQSGVS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1309_008 score:41 alignment:8M1S[2,3]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GE.AF.VVG.V..VAGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C634_004 score:50 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.TL.NN..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1988_011 score:54 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTL.TL.NN..T.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3599 score:39 alignment:4M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGTSGSP.AT.LRV..L~~~
>C1296_004 score:40 alignment:2I5M1S[1,2]1M1I3M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GDPSG.SP.AAERL..L.V..VA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1211_008 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~H..TL.LLPNFDGTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2107_002 score:39 alignment:3M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSL..TL.NN..D.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2745 score:52 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..T..LNTSH..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1220_013 score:84 alignment:9M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VDNL.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3446 score:45 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HSS..SL.LHGDDRLY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C543_002 score:40 alignment:1I1S[1,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLGMELA.CQSGVSS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1881_004 score:39 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..T..LNGMH..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C769_011 score:51 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DFTLKSQKLQTE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3394 score:84 alignment:6M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2161 score:76 alignment:5M1S[2,2]1M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DFTLKSLRLDTE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1663_006 score:41 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SN.DLTL.TL.NN..D.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1619_009 score:53 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..LNTSH..TL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C360_015 score:84 alignment:7M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KN.VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C922_014 score:40 alignment:8M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.LPL.L..S..NGGFA.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1467_007 score:43 alignment:6M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SL.GGN.D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C637_008 score:36 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVNT.SL.QD.KTG..F~~~
>Combined_2731 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDAMLL.CGA.AS.GV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_054 score:87 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_894 score:96 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1969_009 score:84 alignment:4M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQTG..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3396 score:78 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1091 score:73 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1553_006 score:60 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DL..PGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2508_002 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DK..QDGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1168_003 score:39 alignment:1I8M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESQ.SG.SL.L..F..L..GR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C969_004 score:77 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DL..GTER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_400 score:47 alignment:3I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLSSKY.TL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C868_013 score:45 alignment:2I8M2I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DGPSG.SP.AT.LRVL.VL..G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C790_018 score:39 alignment:4M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGTSGSP.AT.LVR..L~~~
>C1063_014 score:66 alignment:7M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KG.VD.R.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2273_003 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..LSESP.L....K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C389_002 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESASQ..R..F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2266 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DM..SPLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1112 score:50 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAWYVQKGPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1680_005 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ATL..S..MYVPL..SL.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1552 score:46 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A..FSVFL..FNTE.NK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1232_008 score:31 alignment:3M3D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQA...Q.SL.PL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C506_006 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLYLYVQKGPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1134 score:64 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SF.QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C235_023 score:72 alignment:6M1I4M1I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.LGKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_587 score:39 alignment:2I1S[2,2]10M unique:False
~~~~~~~~~~GQTVSVG.MLPSASD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1316_004 score:50 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAWYVQKGPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C114_002 score:42 alignment:2I7M2D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSSEKQ..LKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1558 score:40 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTL.EL.LS..D.V.QLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1336_013 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D.VG.VLL.L..T..NNAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C444_017 score:78 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YA..LSSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1731_004 score:42 alignment:12M unique:False
~DLTLYQ.SS.QLLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1723_008 score:43 alignment:3I2M1S[2,2]4M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PALQGSL.QP.VL..SG..L~~~
>C902_004 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.ND..VVDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C177_003 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS..S..CSTSH..PG.VY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1173 score:30 alignment:1I5M5D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QS.VVS.L..........PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1225 score:64 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DL..SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C523_011 score:84 alignment:9M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VDGL.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1409_010 score:38 alignment:1I7M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTN.SL.YN..NNL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C431 score:43 alignment:10M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSSQGMDYKDYW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C854_004 score:55 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.DS..ALER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C560_027 score:91 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..GSTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C643_017 score:73 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YS..GLTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2571 score:39 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSSESEYLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_666 score:55 alignment:11M1S[1,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSDKDLQPVLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C105_019 score:43 alignment:1I8M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~SDLSVA.PGE.ATR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C337_021 score:49 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGSH..SL.LHPSHSYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3804 score:84 alignment:8M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3798 score:91 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL..GTSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1332_002 score:39 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTL.EE..L.L.PLTK..YR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C447_005 score:45 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NDYLAWYVQKGPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C263_007 score:39 alignment:4M1I1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LS.SPASL.HAF..LR~~
>Combined_1118 score:43 alignment:4I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LFLVSL.GS..D.L.TLMG..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_941 score:47 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1394 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LFGVTTL.DVLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_999 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~NSLT.PHEDLTL..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_967 score:88 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1402 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LALLNVELE.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C497_005 score:35 alignment:1I2M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLE.VELE.PVGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C914_009 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT.LQ.QLP.L..L..SN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3334 score:37 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SL.TL..D.N.DLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2432 score:48 alignment:3I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL.TL.SY..D.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3227_002 score:42 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TK.EL.NN..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3523 score:58 alignment:7M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LS.SP.AT.GGS..LR~~
>Combined_2436 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.LVSMNVQQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C77_014 score:34 alignment:11M unique:False
~~LCENQ.SL.DSKS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C282_019 score:32 alignment:6M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SALA.S....Q.PD.RL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2007_002 score:42 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDDL.TL.SL..T.L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C175_008 score:44 alignment:3I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GYPVTH.QDEK.PGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C784_011 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LDTNAYCGLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2884 score:69 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LP.QS.L..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_447 score:35 alignment:1I3M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QS....GS.SEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C132_008 score:57 alignment:3M1S[1,2]4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPAM.TFGQTG..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1183 score:63 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GAP.QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C962_011 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SNL.TL.NN..N.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1181 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGTLSALDLLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C178_022 score:44 alignment:1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQKPGE.KP.NL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1244 score:64 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DP.QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1469_009 score:36 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..PDHEL..TL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1532_011 score:37 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T..LDHEP..TL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1567_011 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PAL.EP.VL.L..S.GL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1776_007 score:32 alignment:5M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNW.VDYT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1138 score:62 alignment:8M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQTG..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1385_009 score:36 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..PNHEL..TL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1628_006 score:41 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..T..LDNSY..TL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C708_014 score:57 alignment:4M1S[2,2]3M1S[2,2] unique:False
~DFVLQT.SP.HVT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1606_009 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..T.L.TLDN..DLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C111_021 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LA.ST.AT.VSP..LR~~
>C1630 score:40 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..T..LDSYN..TL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3706 score:67 alignment:3M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~P.QLSL..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C22_019 score:48 alignment:2M2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKTLAQDYKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1506_003 score:79 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSPW.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2713 score:55 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LP.QS.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3593 score:36 alignment:8M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.A..S.GL..GST.A.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C374_018 score:67 alignment:4M1S[2,2]5M unique:False
~DFVLQT.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_976 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~SL.PLLSNT.CGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3788 score:55 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~SDLSVA.PGETAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_395 score:79 alignment:11M unique:False
~DFVLTQ.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_927 score:42 alignment:1I5M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YN.SL.SGYRD.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C770_003 score:42 alignment:11M unique:False
~~~~LDQ.PM.TELSVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1277 score:53 alignment:4M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPSMTFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C554_006 score:40 alignment:9M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TLSS..PLAEHK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C534_007 score:39 alignment:5M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.K..G.YLLSGSSYA.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_497 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CEPA.LQKGFSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C488_005 score:78 alignment:9M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQAV~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1318_002 score:39 alignment:1I8M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PSL..N..DDSSYP.SL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3080 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DS..L.L.AEVK..AQYE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C171_021 score:36 alignment:6M1S[2,2]1M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QPA.TGT.GT.RAM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C385_020 score:61 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGS..L..KD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C118_007 score:43 alignment:4M1I4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPSMTFGQSA..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1712_011 score:67 alignment:4M1S[2,2]5M unique:False
~DFVLQT.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1764_003 score:38 alignment:1I5M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AFY.PEELSAMVLTK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1623 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSNTDKDDTNSA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1538 score:64 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NP.QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C775_009 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LDSQAYCGLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1692 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDLTLTLSLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C293_008 score:45 alignment:5M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SERF.P.....VPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_143 score:42 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDL.TL.SL..T.L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C359_010 score:60 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSTGF.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1661_011 score:67 alignment:8M1I3M unique:False
~DFVLTQ.SPGHSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_050 score:74 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C383_022 score:76 alignment:6M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1297_010 score:65 alignment:11M unique:False
~DFVVDQ.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3205 score:44 alignment:3I4M1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QASSG.SP.AAL.R..L.TL..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1723_003 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDNL.TL.SL..T.L.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2077 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LTDNAYCGLA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2222_005 score:43 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DDDLTLTLSLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1535_004 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNNHTDNV.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1030 score:69 alignment:3M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPAM.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C798_009 score:37 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GPT.SL.QD.KTG..F~~~
>C674_005 score:64 alignment:8M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2462 score:32 alignment:4M1D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LC.AG..AS.GVC.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C442_014 score:46 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQSRPGL.EP.QL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1989_010 score:39 alignment:1I7M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QK.DSVP.SSPSS..S.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2080_003 score:79 alignment:11M unique:False
~DLVLTQ.SP.LSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2518 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.SN..T.D.THDT..NY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C75_012 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.HS..H.L.MTHT..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_853 score:68 alignment:2M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FL...PPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1697_010 score:58 alignment:2D6M1I3M unique:False
~ .VLTQ.SPGHSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3471 score:88 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2451_005 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TT.PP.VTC.R..P..DNF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_891 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSTL.QDQK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1154 score:57 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2051 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YS.DGLLP.MGN.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1350_007 score:41 alignment:8M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..FPPK.PESKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C176_019 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LS.SP.AR.NST..L~~~
>C1146_002 score:61 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..L.DL..GTER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3565 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..KAM
>C1023_006 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL.L..L.YG..PPSQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C167_016 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.LQSPKQQQQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3166 score:36 alignment:1I7M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL..S.GL..GST.A.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_840 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSSEKLEKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C933_003 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DTHGYM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3163 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..MRA
>C2140_006 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.ND.L..L.AL..FR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2083 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QN.A..L.NG..GLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1899 score:43 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..SRM
>C532_012 score:70 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGFGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C605_011 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~F...S....GSGSDKDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3646 score:39 alignment:7M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTGWTLRM
>Combined_477 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C234_006 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGPHTYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C299_016 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..TRW
>Combined_297 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPW..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_918 score:43 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSG..S..SGSSH..LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C799_007 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDG..PSGKL..W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1444 score:53 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TLDN..AYMEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1813 score:41 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASEDH..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C445_004 score:53 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCM.QDRASPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C490_006 score:38 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ATL.SN..N.E.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_933 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1197 score:80 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_282 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HFSE..SL.LNENMA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1898 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..RAM
>C744_003 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VCPA.LQPVLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1850_003 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PVLQA.LQPVLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1443_012 score:55 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELTL.SL..T.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3605 score:32 alignment:1I5M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSS..T.S.G.SH..AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_863 score:43 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSG..S..GSSSH..LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C212_013 score:36 alignment:1I7M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL..S.AL..GST.A.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1172 score:48 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..L.DL..SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3624 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTS..GRM
>Combined_324 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EVSL.EDSK.AF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C60_010 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VS..CKAPG..SQ.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3257 score:35 alignment:1I3M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLE.PV.PV.LSG..L~~~
>Combined_3365 score:62 alignment:10M unique:False
~DFVLTQ.SP.HG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1915 score:47 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ETH..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_179 score:38 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2492 score:37 alignment:6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LT.QP.VL..SG..L~~~
>Combined_2287 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..T.S.TPGV..ARY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C306_004 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2796_004 score:55 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AYQL.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2752 score:40 alignment:3I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL.TL.SY..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1957_013 score:76 alignment:4I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QPGLGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2356 score:33 alignment:6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.QP.VL..SG..L~~~
>C329 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LV.SL.QD.KTG..F~~~
>Combined_3412 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~P.AL.Q..L.GL..ASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C136_024 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGAQHYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3841 score:68 alignment:1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GST.AS.VVC.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2434_003 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VPA.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2004 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GRF...S....YSYSFAH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C320_004 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSNH..EL.VNTK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_207 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SHG..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1734_005 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FASVFL..FNTE.NK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_389 score:53 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCM.QGSREPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1496_019 score:67 alignment:8M2I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YLRTGS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1000_009 score:53 alignment:10M unique:False
~DFVLTQ.SP.GH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_101 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_180 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QDGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2113 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..MRS
>C1760_004 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.LP.MT.VDF..LR~~
>C16_006 score:48 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQ..SL.LHGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C518_020 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..L.YL..SASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C71_014 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..RSM
>Combined_1041 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.SS..T.L.VQKW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C231_020 score:39 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGDNNRY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C201_029 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHYHAGQY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C299_015 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSL..STYEDLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_499 score:43 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TQH..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1710_006 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T.AS.DVV.V..L..EF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_417 score:37 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QNGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2140_010 score:41 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WLTL.NE..N.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3330 score:35 alignment:2I6M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PALE.VP.VL..SG..L~~~
>C2016_004 score:31 alignment:2I3M3D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WQNA.L...NSQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1944_004 score:41 alignment:1I1S[1,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D AGV.L..A.PL..LSSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2121 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LN.YWSNRYNYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C115_012 score:62 alignment:7M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQAV~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C458_015 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.PRE..AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2308_005 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVPQLEVTF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1586_011 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.L..G.YL..SASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1526_008 score:49 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.GVL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C772_011 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVGENHLGW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C769_015 score:39 alignment:1I9M unique:False
~~~LLTL.SP.VTLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C710_011 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SETVGSLKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2615_007 score:54 alignment:2D7M unique:False
~ .VLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2535_004 score:53 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VL.L..G.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3513 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.T..L.EG..EESR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1745_012 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSLE.DKGTF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3550 score:43 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTL.SY..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2718_011 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLV.TL.VS.MS~~~~~~~
>Combined_3408 score:53 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.L..G.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3385 score:63 alignment:9M unique:False
~DFVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3383 score:54 alignment:2D7M unique:False
~ .VLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1998_009 score:35 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3170 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGLYLEQLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C236_020 score:38 alignment:5M1S[1,2]3M unique:False
~ELQLTAG.RG.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1821_012 score:63 alignment:9M unique:False
~DWVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1017_014 score:61 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MEA.E.E.V..THQGL~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3073 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~DSST.SGHSAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1372_014 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C225_015 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QAGSS.SP.AT.L~~~~~~~~
>C48_013 score:39 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QP.AT.GTG..SRM~
>C1068_008 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LN.YWSNRYNY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3196_003 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVLE.LV...S....GM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C328_008 score:43 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AARD.F....PVPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1932_011 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GP.AW.VVQ.T..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2999 score:38 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HFSE..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_392 score:33 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.FL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C598_007 score:34 alignment:5M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LS..T.L..LYK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C880_004 score:40 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1944 score:34 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NEQ..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C168_012 score:60 alignment:6M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THGQL~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2520 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~SCTST.PGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2968 score:42 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLTL.SY..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C104_013 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSTA.SL.GS..T.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C841_009 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GPGQ.SS.LD.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1951 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NNTA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1082_006 score:30 alignment:1S[2,2]5M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~Q.PL.L..H.SL..SG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3148 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSTA.GL.GS..T.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C985_005 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NNAT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C111_019 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QAS.S....GSPV.RV...S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2330 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSTAA..SFVFK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1335 score:41 alignment:3I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSLTL.SY..D.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C268_002 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET.VS.AVK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3360 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDLTLTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_415 score:72 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQGL~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_386 score:45 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CM.QGSREPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C55_006 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAV.Q....GPPE.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C81_010 score:33 alignment:1I5M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSLA.S....Q.PD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1874 score:35 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GTG..WR~
>Combined_962 score:62 alignment:7M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQVA~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1823_002 score:29 alignment:3M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VNW.VENH.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1014 score:63 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADYEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C869_005 score:54 alignment:2D7M unique:False
~ .VLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3369 score:63 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2407 score:30 alignment:1M1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~V.LD.ELTLAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C217_004 score:45 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CM.QGERSPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1167 score:37 alignment:3I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RHPD.YS.VVL.L..L..R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C87_003 score:45 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..GHTQL~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C922_004 score:43 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSL.SE..T.Y.DLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1309 score:49 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..L.DL..ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1491 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.L..C.GL..LAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_388 score:63 alignment:9M unique:False
~DFVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1357 score:63 alignment:9M unique:False
~DLVLTQ.SP.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1381 score:40 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TS..F.L.TVFK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1755_003 score:36 alignment:3I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GMDTH..SL.LSEDW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_449 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QVSL.QDSK.AF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1797 score:33 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MC.QGSREPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C557_003 score:36 alignment:3M1S[3,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET.VG.TVK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_220 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C117_013 score:33 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.FK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C184_015 score:62 alignment:6M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THANL~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C297_010 score:34 alignment:1I5M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MGDS.NP.LS.RS~~~~~~~
>C2808_004 score:38 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~GGSLTST.PGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C332_009 score:45 alignment:3M1S[3,3]3M unique:False
~DFVTQL.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2769 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KT.LS.VPV.T..L..N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2967 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TS....PSGHVVDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3717 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..N.L.TDCK..KY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..N.L.TNCK..KY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C111_016 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GQ.TP.QR.Q..L.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_390 score:38 alignment:2M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKLTGT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2501 score:32 alignment:4M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~K..VR.L.GLASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C988_005 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YP.QL.L..P.GL..R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C290_002 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSNSE..T..CKY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_478 score:30 alignment:1I5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VV..WHCGVT.T~~~~~~~~~~~~~
>C232_017 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QASG.SS..P.A.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1588 score:38 alignment:5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.TGTLAS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2306_007 score:52 alignment:2I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SFTVAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C420_004 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GY..D..VD.L.MR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C110_019 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..L.EG..EESR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_230 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.NN..N.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2529 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTSLAA..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_225 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLL.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_320 score:34 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3469 score:54 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VL..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2898_002 score:36 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVT..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1605_004 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDLTLLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1230_004 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FEDENFLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C397_007 score:32 alignment:1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ AVA...S....GLGST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C353_005 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.AST.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C352_002 score:34 alignment:3I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MGDS....GGPS.RL...S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1499_009 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~PLTQ.SL.PLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1023 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.S....GVPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C270_027 score:38 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.TGT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_536 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QP.AT.GTG..WR~~
>C802_010 score:32 alignment:8M unique:False
~DWVLLQ.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C90_018 score:32 alignment:4M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.VN.LGSG..K~~
>Combined_1040 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_503 score:55 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SP.VT.KSF~~~~~~
>C751_011 score:51 alignment:4I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RGYAL..L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1827 score:34 alignment:5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.LGTTAS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3373 score:30 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTL.EE..L.L.PL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C75_010 score:33 alignment:3M2S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSSL.GPK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3718 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LST..AAYAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C949_002 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A..PEVSL..PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C238_022 score:46 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3233 score:41 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.GVL.L..L..N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1885_002 score:39 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VMH..SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C456_005 score:34 alignment:6M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VT.LSG..HMR
>C769_005 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..L.LL..AEGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_519 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TL..E.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_717 score:36 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.NN..D.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1484_008 score:54 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGLAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2444_006 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SP.QL.L..L.YL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3345 score:32 alignment:1M1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGLSTAA..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_452 score:34 alignment:2M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKLSAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C440_011 score:46 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..G.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2857 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~P.VT.VSL..PR~~
>Combined_2697 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.STA.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2651 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL..L.DL..DSQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_116 score:32 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TL..M.L.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2058 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VD.T.KTALA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2707 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~LP.LSLSNT.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2477 score:35 alignment:2M1S[1,2]5M unique:False
~~~~LCGA.SL.LSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C199_015 score:39 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RTL..L.EE..GESR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3427 score:54 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASLRA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3323 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.S....GVFP.RD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3654 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDLTLML~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C811_010 score:31 alignment:2M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SE.SL.KEK..L~~
>Combined_2476 score:44 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLLS.SP.VT.LN~~~~~~~
>Combined_1988 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NNT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3444 score:30 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EEL.TT..L.L.PL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3344 score:54 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GT....GVPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2403_005 score:35 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL.DLEL..ATY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2323 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLELLKVE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2881 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LV.SL.ET.K~~~~~~~~
>Combined_1939 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.VL..HTSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C79_006 score:33 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C109_012 score:33 alignment:5M1S[1,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S.SV.VT.GLK~~~~~~~
>Combined_3472 score:46 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C423_009 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T..L..VD.L.AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_119 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PFL..AKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_422 score:40 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NCQGRESPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C929_016 score:36 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVVGL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1119 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.VS..E.L.TK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3376 score:47 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.YL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3098 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..DN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1719 score:47 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..ADY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1118_002 score:28 alignment:4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FSLLSLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2574 score:33 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.NN..D.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3342 score:55 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QS....GVPD.RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C324_003 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..N.L.TLNN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2812 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T.GWG..LRT~
>Combined_3488 score:33 alignment:7M unique:False
~ELQLTQ.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2524 score:56 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C263_021 score:30 alignment:4M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..G.YLR.GTS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C39_015 score:28 alignment:7M unique:False
~~LVLSE.TK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_541 score:36 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_189 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAL..AKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3348 score:45 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLLS.SP.VT.L~~~~~~~~
>C1522_002 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVK..SYW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1571_002 score:37 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NS..W.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C54_015 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQQKYSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1017 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.YL..ARSS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2830 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~VT.WGKSF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3364 score:38 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.YL..SSAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3835 score:37 alignment:7M unique:False
~ELVLTE.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_129 score:33 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C713_008 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SV.TL.L..L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C407_013 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..L..NNTA.Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2696 score:51 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..DNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2361_003 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RSL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_204 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QCSL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C160_010 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~DSLHT.TP.HS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_356 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQEKSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3298 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLPF..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1651 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YELAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_374 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CESL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C626_009 score:38 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHQNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1095_010 score:56 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DFTLKLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2611 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.NN..N.L.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C62 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQEKYSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1963_008 score:37 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LP.QS.L..L.DL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_322 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKLAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3424 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LNYLEQLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2054_007 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NCSL.LNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_098 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQQKSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2650 score:42 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E..T.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3160 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.L..L.HT..S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3145 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QYLS.RP.M~~~~~~~~~~~
>Combined_196 score:31 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLPS.HEELL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1741_004 score:27 alignment:2M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTWKSG..F~~
>C697_016 score:31 alignment:3I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSLTGT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_848 score:35 alignment:4I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NRDVT.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1372_013 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VS.VRV.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1042_009 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LD.A.KRLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1258 score:36 alignment:1M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KFDTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2404_005 score:45 alignment:3I6M unique:False
~TTLLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2771 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DN.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2100 score:28 alignment:1I1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVTRYET~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C60_027 score:32 alignment:2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHVEHA.LQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_637 score:35 alignment:4I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNRVT.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C500_018 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DTPVLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1387 score:34 alignment:6M unique:False
~DLVLDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_420 score:25 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GEDKYW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3389 score:38 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSP.QL.L..Y~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1015 score:48 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCM.QGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1145 score:36 alignment:2M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2481_004 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KE..ALVDW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1523 score:38 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTLMLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1548 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DTLLMSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1437 score:38 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DTLYLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2468 score:35 alignment:4I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVSAA....GSGSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C421_004 score:43 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NDFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C368_005 score:33 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.ES..T.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C352_003 score:48 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2399 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSSRQ.S....F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C49_007 score:42 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YT....GVPD.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C56_005 score:48 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C261_024 score:38 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KYL..ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C651_003 score:35 alignment:4I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DRNVT.L.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3681 score:33 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KYGEGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1041_014 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDE..AKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1256 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FYE.QFSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3303 score:31 alignment:4I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VFPFA..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3433 score:31 alignment:4I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FPFVA..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C415_004 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSLMLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C842_003 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVLLLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2334_009 score:30 alignment:1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYLAWY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3048 score:31 alignment:5M unique:False
~DLTLT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Template Sequence

DIVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHSNGYNYLDWYLQVKPSQSPQLLIYLGSSRASGVPDRFSGSGSDKDFTLKISRVETEDVGTYYCMQGRQTPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSGLRMEC

Recombined Template REC-0-5_002

Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence (TXT)

Preview

Sequence Consensus Overview

Sequence Consensus Overview (TSV)

Preview

Variant Graph

Higher Order Variant Graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence?BargraphThe depth of coverage reported is the sum of all positional scores for that position. This is reported with the same position numbering as the consensus sequence.

Bargraph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence (TSV)

Preview

Scores

Length

Score

Matches

Unique Score

Unique Matches

Order

Alignment

Reads Alignment (FASTA)

Preview

C154

C187

C109_002

C189

C190

C193

Combined_062

C549_002

C553

C90

Combined_079

C544

Combined_085

Combined_3509

C105_002

C116_003

Combined_1138

C102_003

Combined_050

C489

Combined_054

Combined_076

C436

Combined_071

C160_003

Combined_072

Combined_077

C193_002

Combined_080

C551_002

Combined_1274

C173_002

C185

C216_002

C217

C256_003

Combined_220

Combined_098

Combined_101

Combined_180

Combined_322

Combined_326

Combined_1588

Combined_449

Combined_189

Combined_420

C602

Combined_116

Combined_119

Combined_129

Combined_282

Combined_196

C1335

Combined_143

Combined_179

Combined_1587

Depth of Coverage of the Consensus Sequence